Exiqon사의 차세대 디자인 알고리즘으로 제작된 antisense oligonucleotides와 RNaseH-activating 기능을 가진 GapmeR는 뛰어난 mRNA와 lncRNA 기능 억제 능력과 높은 성공률을 보인다.

높은 결합력 (affinity)와 뛰어난 안정성
낮은 세포 독성과 최상의 억제율
낮은 off-target effect와 사용 편의성을 증가시킨 short, single stranded antisense oligonucleotides (ASO)
광범위한 적용- in vitro 또는 in vivo에서 target mRNA와 핵 내의 lncRNA에 적용 가능
Exiqon의 차세대 디자인 알고리즘에 의한 높은 억제효율과 성공률

제품 설명

LNA longRNA GapmeR는 mRNA와 long non-coding RNA (lncRNA) 기능 분석에 사용되는 antisense oligonucleotides (ASO)이다. GapmeR는 양 말단에 LNA modified nucleotides (LNA blocks)와 그 사이 DNA monomer로 이루어진 DNA gap (central stretch)의 구조로 되어있다 (Figure 1). LNA Block 부위는 target에 대한 affinity를 높이고 nuclease에 의한 oligo 분해 내성을 증가시킨다. DNA gap 부위는 target RNA와 결합시 RNaseH가 절단하는 부위로 GapmeR는 14-16 nucleotides로 fully phosphorothioated backbone을 포함하고 있다.

Figure1. Structure and function of the LNA longRNA GapmeRs. Gapmers contain a DNA part flanked by LNA (A). The LNA parts increase the affinity for the target and confers nuclease resistance (B). RNase H is activated by the DNA part of the ASO (C).

GapmeR: RNaseH 활성을 이용하여 효과적으로 유전자 silencing 유도

GapmeR antisense oligonucleotide (ASO)와 RNaseH 활성은 효과적으로 유전자 기능을 억제하는 방법이다. RNaseH는 세포의 핵 (nucleus)과 세포질 (cytoplasm)에서 발견되는 ubiquitous enzyme이다. Target mRNA 또는 lncRNA와 antisense oligonucleotide GapmeR가 서열 특이적으로 결합하면 RNaseH가 RNA-DNA heteroduplex를 인식하여 RNA를 가수분해한다. RNaseH에 의해 분해된 mRNA는 단백질 번역이 저해되어 결과적으로 target protein의 발현이 저해(down regulation)된다 (Figure 2).

Figure 2. Silencing of mRNA and long non-coding RNA using LNA™ longRNA GapmeRs.
LNA™ longRNA GapmeRs can bind to their target RNAs in both the nucleus and cytoplasm of the cell. The targeted molecules are then degraded in an RNase H-mediated process. Upon cleavage by RNase H, degraded mRNA will not be translated into their corresponding proteins which results in down-regulation of the protein.

Table1. Workflow for LNA™ longRNA GapmeRs. Exiqon's gapmers are available for all stages of an inhibition study:from the initial screening to large scale in vivo inhibtion.

상세설명

제품코드	제품명
300600	LNA™ longRNA GapmeR, in vitro Standard, 5 nmol
300601-00	LNA™ longRNA GapmeR, in vitro Premium, ready to label, 5 nmol
300601-04	LNA™ longRNA GapmeR, in vitro Premium, 5’ fluorescein label, 5 nmol
300601-08	LNA™ longRNA GapmeR, in vitro Premium, 3’ fluorescein label, 5 nmol
300602-00	LNA™ longRNA GapmeR, in vivo Ready, ready to label, 5 nmol
300602-04	LNA™ longRNA GapmeR, in vivo Ready, 5’ fluorescein label, 5 nmol
300602-08	LNA™ longRNA GapmeR, in vivo Ready, 3’ fluorescein label, 5 nmol
300603-00	LNA™ longRNA GapmeR, in vivo Ready, ready to label, 20 nmol
300603-04	LNA™ longRNA GapmeR, in vivo Ready, 5’ fluorescein label, 20 nmol
300603-08	LNA™ longRNA GapmeR, in vivo Ready, 3’ fluorescein label, 20 nmol
500175	Custom LNATM longRNA GapmeR for in vivo use, modifications on demand, custom large scale (mg)