· Complex가 무혈청 배지에 있는 cell에 첨가된 경우
무혈청 배지에서 complex를 형성하고 complete growth media(혈청 함유)에 있는 cell에 첨가한다. Complex를 complete growth media에 있는 cell에 첨가하여 4시간 동안 배지 교환이 없으면 transfection의 효율이 개선되고 독성이 감소한다.

· Cell density(% confluence)가 transfection 당시에 최적이 아닌 경우
Transfection을 하는 시점에서, 대부분의 cell에 대한 권장 cell density는 50-70% confluence이다. 그러나 transfection의 효율 을 극대화하기 위해서는 각 cell 유형에 따라 최적인 cell density를 정할 필요가 있는 경우도 있다. 향후 실험에서 재현성을 정확 하게 하려면 밀도를 일정하게 유지해야 한다.

· Transfection에서TransIT®-LT1 시약/DNA complex의 양이 과도한 경우
Cell에 첨가되는 IT®-LT1 시약 또는 DNA의 양을 줄인다.

· TransIT®-LT1 시약/DNA complex가 well 안의 cell들과 완전하게 섞이지 않은 경우
모든 cell에 complex가 퍼지도록 잘 섞어 준다.

· Cell 형태가 변화되는 경우
만약 cell passage number가 매우 높거나 너무 낮다면 transfection의 효율에 나쁜 영향을 끼친다. 재현성을 높이려면 실험간 비슷한 passage number를 유지한다.