Protein-protein interaction을 선별하기 위해 HIS3 nutritional reporter 만 을 사용하는 Yeast two-hybrid 시스템은 종종 많은 수의 (ⅰ) background colony와 (ⅱ) false positive를 생성합니다.

Background colony들은 nutritional reporter가 일부 발현이 되었거나 또는, 너무나 빽빽하게 plating되었을 경우 나타납니다. 반면, false positives는 bait 와 독립적으로, prey proteins이 reporters의 upstream 서열을 인식하여 결합 하기 때문에 발생됩니다.
Aureobasidin A (TaKaRa Code 630466)은 새로운 yeast two-hybrid 항생제 로 저항성이 없는 모든 세포를 매우 효과적으로 죽이는 효능과 안정성 때문 에 Matchmaker gold 시스템에서는 background colony growth가 거의 불가 능 합니다.

추가적으로 Matchmaker™ Gold는 false postives를 감소시킵니다. 왜냐하면 독립적으로 결합한 prey protein이 3 개의 recognition sequences에 결합해야 하고 4 종류의 reporters가 활성화되어야 하기 때문입니다. Matchmaker™ Gold는 3 개의 다른 bait recognition sequence/promoter에 의해 4 개의 진짜 reporter가 조절되어지는 yeast two-hybrid 전용 system입니다.