전기영동 후 염색(post-staining)하면 염색이 균일하게 일어나기 때문에 선명하고 균일한 band를 확인 할 수 있습니다. 또한 염색시약을 여러 번 사용할 수 있기 때문에 gel 수가 많은 경우에는 적은 양의 염색시약를 사용하여 gel 염색을 할 수 있습니다. Gel에 직접 염색시약를 넣는 경우(Pre-staining)에는 gel을 만들 때 염색시약을 함께 넣어야 하기 때문에 균일한 염색이 어려운 단점이 있지만, 염색 시간을 단축할 수 있습니다.
SYBR Green을 미리 첨가한 gel을 이용한 경우, 전기 영동 후 염색하는 방법에 비해 감도가 저하됩니다. 또한 DNA의 이동속도가 다르기 때문에 SYBR Green 사용시 pre-staining 방법으로 염색하는 것은 권장하지 않습니다.
GelStar를 미리 넣은 gel을 사용한 경우, DNA의 이동속도는 GetStar를 넣지 않은 gel보다 천천히 전기영동됩니다.