· TaKaRa MiniBEST Plasmid Purification Kit (Code 9760A)
일반적으로 2 ml pUC118/JM109의 LB배양액으로부터 10 μg의 고순도의 plasmid를 추출 할 수 있습니다. Plasmid DNA의 회수율이 낮다면, 다음과 같은 사항을 확인해야 합니다.
(1) E. coli가 오래된 경우 (장기간 보관, 낮은 온도).
고체배지에 도말하여 배양 후, 새로운 콜로니를 pick-up하여 액체배지에서 재배양합니다.
(2) Plasmid의 copy 수가 너무 낮을 경우.
Low-copy plasmid를 사용할 경우, plasmid DNA의 회수율이 낮으므로 세균 배양액 양을 늘립니다.
(3) 정확하게 매뉴얼에 따라 진행합니다.
(4) Elution Buffer 또는 멸균 증류수를 60℃에서 예열하여 사용하시면 elution 효율을 높일 수 있습니다.

· TaKaRa MiniBEST DNA fragment Purification Kit (Code 9761A)
일반적으로 DNA의 회수율은 70 – 95%입니다. DNA의 회수율이 낮다면, 아래 사항을 확인해야 합니다.
(1) Buffer WB에 첨가한 100% ethanol의 양을 확인해야 합니다 (56 ml 첨가).
(2) Ethanol은 DNA elution 효율에 영향을 줄 수 있습니다. Elution과정 전의 원심분리는 잔여 ethanol을 제거하기 위함이므로 생략하실 수 없습니다.
(3) Elution Buffer 또는 멸균 증류수를 60℃에서 예열하여 사용하시면 elution 효율을 높일 수 있습니다.

· TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit (Code 9762A)
일반적으로 DNA의 회수율은 50 – 80%입니다. DNA의 회수율이 낮다면,
(1) Agarose gel 양이 많은 경우.
하나의 column은 300 mg의 gel 조각으로부터 50 – 80%의 DNA를 회수할 수 있습니다. Gel이 300 mg이상이라면, 여러 개의 column을 사용해서 진행해야 합니다.
(2) Buffer WB에 첨가된 100% ethanol의 양이 정확한지 확인합니다.
(3) Agarose gel이 완전히 녹지 않은 경우.
완전히 녹지 않은 gel은 DNA 회수율에 영향을 미칩니다. Tube inverting을 하면 gel을 효과적으로 녹일 수 있습니다.
(4) Agarose gel 용해액 (melting solution)의 pH가 높은 경우.
용해액의 색이 노란색에서 주황색이나 보라색으로 변한다면 용액의 pH가 높은 상태입니다. 3 M sodium acetate (pH 5.2) 10 ml를 넣어 용해액 색이 노란색이 될 때까지 섞어줍니다.
(5) 원심분리를 상온에서 하면 spin column membrane과 DNA의 결합을 향상시킬 수 있습니다.
(6) Ethanol은 DNA elution 효율에 영향을 줄 수 있습니다. Elution과정 전의 원심분리는 잔여 ethanol을 제거하기 위함이므로 반드시 진행해야 합니다.
(7) Elution Buffer 또는 멸균 증류수를 60℃에서 예열한 후 사용하면 elution 효율을 높일 수 있습니다.