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제목 : 정제된 RNA내에 genomic DNA오염의 원인은 무엇인가요? (Code 9767A, 9769A)
작성자 : 다카라코리아

gDNA Eraser Spin Column을 사용하여 샘플에 존재하는 genomic DNA를 효과적으로 제거할 수 있습니다. 일반적으로 정제된 RNA는 genomic DNA가 포함되어 있지 않으나, genomic DNA가 포함되어 있다면, 이유는 다음과 같습니다.

  • 불충분한 용해 (lysis)와 비균질화 (homogenization)경우.

  • 완전히 용해 되지 않으면 genomic DNA가 남게 되므로, 완벽한 샘플용해가 필요합니다(매뉴얼에서 조직이나 세포의 용해 및 균질화 방법에 대한 자세한 사항을 참고).
  • 샘플 양이 많은 경우.

  • 많은 양의 샘플은 gDNA Eraser Spin Column에서 정제 가능한 용량을 초과하는 핵산을 포함하며, 그 결과 genomic DNA가 잔존하게 됩니다 (샘플의 양과 Buffer RL의 양에 관한 자세한 사항은  “VI. sample amount and Buffer RL volume”을 참고).
  • 샘플 내 genomic DNA가 많이 존재하는 경우.

  • Genomic DNA는 조직마다 존재하는 양이 다르며, genomic DNA가 많이 포함된 경우, 샘플 양을 줄이고, Buffer BL/Buffer PE나 DNase I의 양을 증가시킵니다.
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