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Encore Whole Blood RNA-Seq Library Systems

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제품설명
Encore Whole Blood RNA-Seq Library Systems은 성인 전혈에서 추출한 100 ng의 total RNA로 strand-specific RNA-Seq library를 구축할 수 있는 제품이다. Total RNA부터 library 구축까지 전과정이 재현성이 높고 대략 7시간 정도면 실험을 완료할 수 있다. Insert Dependent Adaptor Cleavage (InDA-C) technology로 원치 않는 아주 풍부한 transcripts를 타겟하여 감소시킴으로써 human rRNA (12S, 16S, 18S and 28S genes)와 adult human reticulocyte globin (HBA1, HBA2, HBB and HBD genes)으로부터 유래된 sequencing reads를 눈에 띄게 감소시킬 수 있기 때문에 sequencing에 소모되는 자원을 더 효과적으로 이용할 수 있다.

Encore Whole Blood RNA-Seq Multiplex System 1-8 (Part No. 0337-32)와 Encore Whole Blood RNA-Seq Multiplex System 9-16 (Part No. 0338-32)는 각각 8개의 unique barcoded adaptors를 제공하기 때문에 더 효과적으로 multiplex sequencing이 가능하며 transcriptome sequencing시 비용을 절감할 수 있다. 이 두 Kit를 함께 사용하면 Illumina NGS platforms의 lane 당 16개의 샘플까지 multiplexing이 가능하다.

Encore Whole Blood RNA-Seq Library Systems은 second strand cDNA 합성 및 ligation시 하나의 strand에 동일한 analogue를 포함한 double-stranded library adaptors 중 한쪽에 nucleotide analogue를 결합시켜 strand-specific expression analysis을 할 수 있도록 설계되었다.

Ligation 후 cDNA strand과 analogue를 포함한 adaptor는 선택적으로 제거되고 양쪽 adaptor sequences를 가진 하나의 cDNA strand만 남게 된다. 이 product는 PCR 증폭에 의해 sequence-ready library로 전환된다(Figure 1. 참조).

Figure 1:


Figure 2: Effect of InDA-C Treatment on Four Independent Samples


Keyword :
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DNA/RNA 증폭 (NuGEN)
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