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Home > 전제품보기 > DNA/RNA 정제 · 표식 > DNA/RNA 증폭 (NuGEN) > Ovation Universal RNA-Seq System
InDA-C기술을 이용한 strand-specific RNA-Seq library 제작

Ovation Universal RNA-Seq System

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
데이터가 없습니다

  • InDA-C 기술을 이용해 NGS 분석에 불필요한 서열을 효율적으로 제거
  • 다양한 조직이나 세포로부터 NGS용 Library 제작
  • Strand-specific RNA-Seq library 구축
  • Multiplex sequencing을 통한 분석비용 절감
제품설명
Ovation Universal RNA-Seq System은 다양한 조직이나 세포로부터 추출한 나노그램(nanogram) 수준의 Total RNA를 이용하여 strand-specific RNA-Seq library를 구축하는 제품으로, 약 7시간만에 Total RNA로부터 library를 제작 가능하다. 본 제품은 Insert Dependent Adaptor Cleavage(InDA-C)기술을 기반으로 제작되었다. 본 기술은 불필요한 서열을 제거할 수 있는 특정한 InDA-C primer를 이용함으로써 불필요한 전사체(transcript)의 양을 줄인 Library를 제작할 수 있기 때문에 어떠한 종의 전사체로도 이용 가능하며 불필요한 전사체 리드수를 줄이고 의미있는 sequencing read의 비율을 증가시킬 수 있다.
본 제품에는 16종류의 바코드 어댑터(Barcode adaptor)가 포함되어있어 Illumina의 NGS 분석기를 이용하여 Multiplex sequencing을 진행할 수 있다. 본 제품에는 RNA-Seq library 구축에 필요한 시약이 모두 포함되어 있으며 목적에 따른 InDA-C primer를 준비하여 효율적으로 library를 제작 가능하다. NuGEN사에서는 InDA-C primer 무상 설계 서비스를 제공한다*.

* InDA-C primer 무상디자인 서비스는 NuGEN이 직접 진행하는 건으로, 디자인을 원하시면 techserv@nugen.com로 연락하십시오.


그림 1. Ovation Universal RNA-Seq System workflow.

표 1. Examples of targeted transcript depletion using InDA-C technology


표 2. Targeted depletion of rRNA in mouse
내용
Ovation Universal RNA-Seq System 1-16 (Code 0343-32)
  • First Strand Random Primer Mix
  • First Strand Oligo dT Primer Mix
  • First Strand Primer Buffer Mix
  • First Strand Buffer Mix
  • First Strand Enzyme Mix
  • Second Strand Buffer Mix
  • Second Strand Enzyme Mix
  • Second Strand Stop Buffer
  • End Repair Buffer Mix
  • End Repair Enzyme Mix
  • End Repair Enhancer
  • Ligation Buffer Mix
  • Ligation Enzyme Mix
  • Strand Selection Buffer Mix I
  • Strand Selection Enzyme Mix I
  • Strand Selection Buffer Mix II
  • Strand Selection Enzyme Mix II
  • Strand Selection Reagent
  • Strand Selection Enzyme Mix III
  • Adaptor Cleavage Enzyme Mix
  • Amplification Buffer Mix
  • Amplification Primer Mix
  • Amplification Enzyme Mix
  • Nuclease-free Water
  • Agencourt RNAClean XP Beads
  • DR Ligation Adaptor Mixes
보존
Agencourt RNAClean XP Beads: 4 ℃
그 외의 시약: -20 ℃
Kit 이외에 필요한 시약
  • Ethanol (Sigma-Aldrich, Cat.#E7023), for purification steps
  • Covaris S-series Sonication System등 fragmentation을 위한 기기 및 시약
  • Spectrophotometer
  • Agilent 2100 bioanalyzer등 핵산 분석 장치 및 검출 시약
  • Agencourt SPRIStand등의 마그넷 스탠드
  • PCR 기기

*Ovation은 NuGEN Technologies의 등록상표입니다.

Keyword :
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DNA/RNA 증폭 (NuGEN)
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