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Encore ds-DNA Module

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비고 사용자매뉴얼
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  • NGS 분석을 이용한 library 제작을 위한 dsDNA를 조제
  • 3 시간 이내에 반응 완료
제품설명
Encore ds-DNA Module은 NGS 분석을 위한 library 제작에 필요한 dsDNA(평활말단)를 조제하기 위한 kit이다. 본 제품으로 조제한 dsDNA는 별도의 처리없이 Encore NGS Library/Multiplex System I* 이용한 library 제작에 사용할 수 있다. 본 제품은 NuGEN의 Ovation WGA FFPE System을 사용하여 증폭된 게놈 DNA로 검증하였다.

* Encore ds-DNA Module에 의해 조제한 dsDNA를 Encore NGS Library/Multiplex System I에 이용할 경우 일부 프로토콜의 변경이 필요합니다. 자세한 내용은 Encore ds-DNA Module의 사용 설명서를 확인하십시오.

2500-08_01

1 Illumina GAIIx의 8-plex, paired-end sequencing 의해 얻은 read 수
2 양방향 해석을 기준으로 3 kb이상 떨어져 매핑된 chimera율
3 Paired-end sequencing에서 forward와 reverse의 평균 에러율

표 1. NGS 애플리케이션에 적절한 quality sequencing 결과
게놈 구조의 변화를 정확하게 결정하기 위해서는 증폭 에러와 편향을 최소화 할 필요가 있다. 이것들을 검증하기 위해, Encore NGS Multiplex System I에 사용하는 dsDNA를 조제시 Ovation WGA FFPE System과 Encore ds-DNA Module을 이용해 S. cerevisiae DNA 샘플을 조제하였다. 증폭한 library (WGA1 및 WGA2)와 증폭하지 않은 gDNA를 동시에 Illumina Genome Analyzer IIx를 이용하여 sequencing하였다(표 참조).
모든 샘플에서 높은 확률로 정확한 얼라이먼트와 낮은 에러율을 얻을 수 있었다. 특히, WGA 샘플과 증폭하지 샘플 양쪽 모두에서 매우 유사한 에러율과 chimera율(샘플 조제 중에 일어난 strand의 반복)을 얻을 수 있었다.
내용
· DS Primer
· DS Buffer
· DS Enzyme
· DS End Repair Buffer
· DS End Repair Enzyme
· Nuclease - free Water
· Agencourt RNAClean XP Beads
보존
Agencourt RNAClean XP Beads (투명 뚜껑) : 4 ℃
기타 : -20 ℃

Encore는 NuGEN Technologies 사의 trade mark입니다.

Keyword :
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DNA/RNA 증폭 (NuGEN)
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