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500 pg~50 ng의 total RNA에서 μg수준의 cDNA를 5시간 이내에 증폭

Ovation ® Pico/PicoSL WTA System V2

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
데이터가 없습니다

  • 불과 500 pg의 total RNA에서 μg수준의 cDNA를 증폭
  • Encore Kit과 함께 사용하면, 다양한 Array 분석 가능
  • 증폭한 cDNA는 바로 qPCR에 사용 가능
제품설명
Ovation Pico WTA System V2와 Ovation PicoSL WTA System V2는 SPIA (Single Primer Isothermal Amplification) 기술을 이용한 신속하고 간편하며 고감도인 cDNA 증폭 시스템이다. 4.8 시간 이내에 500 pg~50 ng의 total RNA에서 μg수준의 cDNA를 증폭할 수 있다. 증폭은 Oligo dT primer와 Random primer를 같이 이용하고, total RNA의 전체 영역에서 반응이 일어나므로, poly (A) tail이 결손된 전사 산물이나 부분적으로 분해가 일어난 순도가 낮은 RNA 샘플에서도 유전자 발현 해석에 이용할 수 있는 cDNA를 조제할 수 있다.

※ SPIA (Single Primer Isothermal Amplification) technology란?

Ovation Pico WTA System V2를 이용해 증폭한 cDNA는 Encore Biotin Module에 의해 단편화, Biotin 표지 과정을 거쳐 Affymetrix GeneChip 3' expression array나 Exon ST array, Gene ST array에 사용할 수 있다. 한편, Ovation PicoSL WTA System V2를 이용해 증폭한 cDNA는 Illumina Whole Genome Expression BeadsChip 또는 Agilent Dual-Mode Gene Expression Chip에 사용할 수 있다.

* Ovation Pico WTA System V2와 Ovation PicoSL WTA System V2의 차이

 

Ovation Pico WTA System V2

Ovation PicoSL WTA System V2

초기 RNA 양

500 pg~50 ng

cDNA 합성량

≥6 μg

2~5 μg

추천 Platform

Affymetrix GeneChip

Illumina Whole Genome Expression BeadsChip, Agilent Dual-Mode Gene Expression Chip


* GeneChip를 이용한 기존 제품과 비교

제품명

반응량

초기 RNA량

합성 cDNA양

%P

SF

Actin

GAPDH

Ovation Pico WTA System

160 μl

500 pg

7.06 μg

52.73

1.55

3.34

0.91

Ovation Pico WTA System V2

100 μl

500 pg

7.65 μg

59.92

0.97

1.25

0.84


HeLa cell에서 추출 · 정제한 RNA에서 Ovation Pico WTA System V2와 Ovation Pico WTA System을 이용해 cDNA를 조제하였다. 조제한 cDNA는 Encore Biotin Module를 이용하여 단편화, Biotin 표지 과정을 거쳐, GeneChip Human Genome U133A 2.0 array에 hybridization하였다. 이 결과, Ovation Pico WTA System V2로 조제한 cDNA에서 %P(유효 spots 수)가 기존제품에 비해 높아졌으며, Actin와 GAPDH의 비율은 감소하였다. 즉, 전사 산물의 커버율과 발현량의 많지 않은 전사 산물을 이용함에도 representation이 향상되었음을 확인할 수 있다. 또, Ovation Pico WTA System V2는 반응량은 적지만, cDNA 합성량은 증가하였다.
SF:Scaling factor의 줄임말. 시그널의 평균치를 500에 보정하기 위한 계수. 이 값이 낮으면 시그널 강도가 높은 것으로 판단한다.

※ Ovation Pico WTA System V2 과 PicoSL WTA System V2 출시
- Ovation Pico WTA System(Code 3300) 과 Ovation PicoSL WTA System(Code 3310)은 종매되었습니다.
내용
First Strand Primer Mix
First Strand Primer Mix
First Strand Enzyme Mix
Second Strand Buffer Mix
Second Strand Enzyme Mix
SPIA Primer Mix
SPIA Buffer Mix
SPIA Enzyme Mix
Nuclease-free Water
Agencourt RNAClean Beads

[주의] Ovation Pico WTA System V2, Ovation PicoSL WTA System V2를 구성하는 시약 명칭은 동일합니다만, 호환되지 않습니다.
보존
Agencourt RNAClean Beads 4℃
그 이외의 시약 20℃

Ovation은 NuGEN Technologies의 trade mark입니다.

Keyword :
-
DNA/RNA 증폭 (NuGEN)
데이터가 없습니다
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