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Ovation FFPE WTA System

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
데이터가 없습니다

  • 파라핀 포매 절편(FFPE) 에서 추출한 분해된 RNA의 증폭에 최적.
  • FFPE 샘플에서 추출한 RNA 50 ng에서 μg수준의 cDNA 증폭 가능.
  • qPCR나 각종 microarray 해석에 사용 가능.
제품설명
Ovation WTA FFPE System은 FFPE 샘플의 분해된 RNA를 사용하여 발현 해석이 가능하게 하는 whole transcriptome 증폭 시스템이다. FFPE 에서 추출한 불과 50 ng의 RNA에서 μg수준의 cDNA를 증폭할 수 있다. 또한, 모든 과정이 불과 5시간 안에 종료된다. 이 시스템으로 증폭한 cDNA는 Real Time 정량 PCR, microarray 해석을 위한 단편화 및 라벨링에 사용할 수 있다.

NuGEN의 FFPE용 cDNA 증폭 시스템 Ovation WTA FFPE System은 단순화한 실험과정을 통해, 높은 감도와 재현성을 나타낸다. 이 새로운 시스템을 이용하면 보다 많은 전사 산물의 검출이 가능해져, 보다 높은 유효 spot율(%P)을 얻을 수 있다. 또한, Actin과 GAPDH 비율이 낮아져, RNA 커버율과 반복 실험의 재현성이 향상되었다(표 1). 또 하나의 특징은 single step 증폭 반응과 실험과정을 간소화하여 전체 실험 시간이 기존 제품을 사용했을 때 보다 1시간 단축되었다.

Affymetrix GeneChip 3' Exon ST array나 Gene ST Expression array를 사용할 때는 Encore Biotin Module를 이용하면 증폭된 cDNA를 2시간 이내에 단편화할 수 있다.

※ Ovation WTA FFPE System 출시에 따라 WT-Ovation FFPE RNA Amplification System V2(Code 3400)는 종매 되었습니다.

제품명

초기Total RNA 양

cDNA Yeild

%P

SF

Actin

GAPDH

Ovation WTA FFPE System

50 ng

7.14 μg

62.8

2.48

3.6

2.46

WT-Ovation FFPE System V2

50 ng

7.14 μg

49.9

6.00

5.4

3.


표 1. Array Performance Metrics with FFPE RNA: cDNA targets were prepared from triplicate determinations of RNA extracted from formalin fixed paraffin embedded tissue (FFPE) using either Ovation FFPE WTA System or WT-Ovation FFPE System V2. The amplified cDNA was fragmented and labeled using the Encore Biotin Module, and hybridized to GeneChip® Human Genome U133A 2.0 arrays. The data shows an increase in %P values with the Ovation FFPE WTA Systems together with reduced Actin and GAPDH ratios which illustrates improvements in both transcript coverage and representation of less abundant transcripts.
SF : Scaling factor의 약자. 신호의 평균을 500으로 보정하기 위한 계수. 이 값이 낮으면 신호 강도는 높은 것으로 판단한다.
내용
  • First Strand Primer Mix
  • First Strand Buffer Mix
  • First Strand Enzyme Mix
  • Second Strand Buffer Mix
  • Second Strand Enzyme Mix
  • SPIA Primer Mix
  • SPIA Buffer Mix
  • SPIA Enzyme Mix
  • Nuclease - free Water
  • Agencourt RNAClean XP Beads
장비 이외에 필요한 시약
SPRIPlate 96R, Ring Magnet Plate (BECKMAN COULTER #A29164) 또는 SPRIPlate Ring Super Magnet Plate (BECKMAN COULTER #A32782). 다른 제품도 사용 가능할 것으로 생각되지만, 제조사에서는 명시하고 있지 않음.
보존
Agencourt RNAClean XP Beads (투명 뚜껑)    4 ℃
그외 -20 ℃

Ovation은 NuGEN Technologies의 trade mark입니다.

Keyword :
-
DNA/RNA 증폭 (NuGEN)
데이터가 없습니다
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