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Encore SP+ Complete DR Multiplex Systems

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제품설명
Encore SP+ Complete DR Multiplex Systems은 100 ng의 total RNA로 strand-specific RNA-Seq library를 구축할 수 있는 제품으로 자동화 시스템인 Mondrian SP+ Workstation용 제품이다. 이 제품에서 사용되는 핵심 기술은 first strand cDNA 합성하는 동안 NGS library내 non-ribosomal mRNA를 농축하는 기술로 다양한 eukaryotes로부터 추출한 transcriptome에 적용할 수 있다. rRNA를 줄이기 위한 전용 단계가 필요 없다. RNA strand 정보를 유지하는 double-stranded cDNA를 합성하는데 특허 primer가 사용된다. 연구자의 개입 없이 단일 과정으로 cDNA가 Illumina sequencing platform용 NGS library로 전환된다. Encore SP+ Complete DR Multiplex Systems은 multiplexing 적용을 위한 선택적으로 barcode를 제공한다.

실험과정은 아래와 같은 단계로 구성되어 있다.
1. Addition of total RNA and reagents to the Mondrian SP+ Cartridge

2. Hands-free automation of the following assay steps on the Mondrian SP+ Workstation:
  • Sample concentration
  • 1st and 2nd strand cDNA synthesis
  • Sample purification
  • Enzymatic fragmentation
  • Sample purification
  • End repair
  • Sample purification
  • Adaptor ligation
  • Sample purification
  • Library enrichment
  • Enriched library purification

3. Collection of the final enriched, purified library droplet from the cartridge

4. The following steps are conducted separately from the Mondrian SP+ Workstation:
  • Quantification
  • Cluster formation and sequencing (with optional sample multiplexing)

Encore SP+ Complete protocol은 전체 10시간 정도 걸리 과정 중 수작업이 필요한 부분은 30분 미만으로 수동인 Encore SP+ Complete protocol과 비교해 수작업 시간이 90% 감소했다.

Encore SP+ Complete DR Multiplex System 1-8 (Part No. 8151)과 Encore SP+ Complete DR Multiplex System 9-16 (Part No. 8152) 양쪽 모두 multiplex sequencing에 8개의 unique barcoded adaptors를 제공한다. 두 kit를 조합해 사용하면 dedicated read (DR) barcode design을 이용해 16-plex sequencing까지 가능하다.

Encore SP+ Complete DR Multiplex Systems은 Mondrian SP+ Workstation (Part No. 8100)에만 적용 가능하다.
Mondrian SP+ Workstation 정보 확인하기

Keyword :
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DNA/RNA 증폭 (NuGEN)
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