Capturem™, His60, TALON® 시약 호환성
당사에서 판매하는 his-tagged protein 정제를 위한 제품은 단백질 정제 과정에서 주로 사용되는 다양한 첨가제에 대한 호환성을 가지고 있다. 각 첨가제에 대한 제품 별 호환성을 아래의 표에서 확인할 수 있다
■ Capturem™ nickel column 시약 호환성
Capturem™ his-tagged protein purification column은 높은 capacity의 Ni-NTA membrane을 사용해 다양한 조건에서 고농도의 recombinant protein을 빠르게 정제한다. 이 column은
xTractor Buffer (Code 635656) (miniprep과 maxiprep의 경우 제품 내 포함되어 있음)와 이외 다양한 조성의 lysis buffer를 같이 사용할 수 있다. 또한 native 또는 denaturing 조건이나 첨가제 (e.g. EDTA, βME, TCEP, DTT 등)의 존재 하에서도 일관된 정제 결과를 보인다.
Capturem™ nickel column과 호환되는 reagent
Reagent |
Compatibility* |
MOPS |
200 mM |
HEPES |
200 mM |
Tris |
200 mM |
EDTA |
10 mM |
Beta-mercaptoethanol |
30 mM |
DTT |
10 mM |
TCEP |
5 mM |
Guanidine-HCl |
6 M |
Urea |
8 M |
Nonionic detergent (Triton X-100) |
2% |
Nonionic detergent (Tween 20) |
2% |
Anionic detergent (SDS) |
1% |
Arginine |
500 mM |
Glycine |
100 mM |
Histidine |
20 mM |
Sodium chloride |
2 M |
Imidazole |
40 mM |
Glycerol |
10% |
*현재까지 테스트된 호환 가능한 최대 농도.
■ His60 Nickel resin reagent 시약 호환성
His60 Ni resin은 높은 capacity의 Ni-IDA resin으로, one step으로 native 와 denaturing 조건의 his-tagged protein을 모두 정제할 수 있다. 이 resin은 다양한 denaturant 및 detergent와 같이 사용 가능하며 (전체적인 시약 호환성은 제품 사용자 매뉴얼 참고), 정제된 recombinant his-tagged protein은 300 mM imidazole을 첨가하거나 pH를 낮추어 elution 할 수 있다.
His60 Nickel resin과 호환되는 reagent
Reagent |
Acceptable Concentration |
Beta-mercaptoethanola |
20 mM (with caution) |
CaCl2 |
5 mM |
CHAPSb,c |
1% (with caution) |
DTT (dithiothreitol)d |
1 mM (with caution) |
Ethanole |
20% |
Glycerol |
20% |
Guanidine hydrochloridef |
6 M |
HEPESg |
Up to 100 mM (with caution) |
Histidineh |
- 20 mM to inhibit nonspecific binding
- Up to 100 mM to elute his-tagged proteins |
MgCl2 |
4 M |
MOPSg |
Up to 100 mM (with caution) |
NP-40b,i |
2% |
SDSb,c |
1% (with caution) |
Sodium acetate |
Up to 100 mM (with caution) |
Sodium phosphate |
Up to 50 mM |
Trisj |
Up to 50 mM (with caution) |
Triton-X 100b,i |
1% |
Tween 20 |
2% |
Ureaf |
8 M |
a Beta-mercaptoethanol을 포함한 buffer를 사용하는 경우 equilibration 후 바로 resin을 사용한다. 그렇지 않은 경우 resin의 색이 노란 색으로 변색될 수 있다. 이 buffer로는 resin의 보관이 불가능하다.
b 이러한 detergent는 버퍼를 교환해도 쉽게 제거되지 않는다.
c CHAPS (3-[(3-Cholamidopropyl)-dimethylammonio]-1-propane-sulfonate), SDS (sodium dodecyl sulfate), sarkosyl 같은 ionic detergent는 최대 1% 까지만 적용 가능하다. 그러나 전하를 띄는 특성으로 인해 낮은 농도에서도 단백질 결합에 방해가 될 수 있다.
d DTT는 환원제이기 때문에 농도가 낮으면 His60 Ni Superflow resin의 metal ion을 탈락시킬 수 있다. 단백질을 정제하기에는 충분한 양이 남아있으면 사용할 수 있으나 주의해 사용해야 한다. 최소 column volume의 20배 이상으로 wash를 진행하고 이때 저농도의 imidazole (40 mM)을 사용해 탈락된 metal ion을 wash한다.
e Ethanol은 단백질을 침전시켜 수율을 감소시키고 column을 막히게 할 수 있다.
f 고농도에서는 일반적으로 단백질이 unfolding되고, column에서 혹은 elution 후 refolding 된다 (단백질에 따라 다름).
g Amine group이 이 buffer에 있는 경우 Ni2+ ions과 상호작용해서 resin의 binding capacity를 감소시킬 수 있다.
h Resin에 있는 His60 Ni와 his-tag에 있는 histidine 잔기와의 결합에 경쟁하여 저해한다.
i 280 nm 파장대에서 높은 흡광도를 가진다.
j tris는 금속 이온과 약하게 상호작용하여 resin의 capacity를 감소시킨다.
His60 Nickel resin과 호환되지 않는 reagent
아래의 시약은 어떤 농도로도 resin에 적용이 불가능하다 |
- Arginine, glycine, glutamine
- EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid), EGTA (ethylene glycol tetra acetic acid), and PEI
주의: 이러한 킬레이트 시약을 사용하면 resin에서 metal 이온을 탈락시켜 단백질을 elution 시키거나 resin의 색을 변화시킬 수 있다.
- DTE (dithioerythritol)
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■ TALON® cobalt resin reagent 시약 호환성
TALON
® purification resin은 his-tagged protein을 매우 높은 순도로 native 혹은 denaturing 조건 상관없이 bacterial, mammalian, yeast, baculovirus에 감염된 cell 등에서 정제할 수 있다. TALON
®은 cobalt가 들어간 IMAC (Immobilized Metal Affinity Chromatography) resin으로 nickel이 들어간 resin 보다도 더욱 특이적으로 his-tagged 단백질과 결합한다. 따라서 TALON
® resin은 가장 높은 순도의 his-tagged protein을 정제할 수 있다. 또한 각각의 cobalt 이온은 4개의 부위에서 resin과 결합하기 때문에 금속 이온의 탈락이 매우 적다.
TALON® cobalt resin과 호환되는 reagent
Reagent |
Acceptable Concentration |
Beta-mercaptoethanola |
10 mM (with caution) |
CHAPSb |
1% (with caution) |
Ethanolc |
30% |
Ethylene glycol |
30% |
HEPES |
50 mM |
Glycerol |
20% |
Guanidine hydrochloridea |
6 mM |
Imidazoled |
200 mM at pH 7.0-8.0, for elution |
KCl |
500 mM |
MES |
20 mM |
MOPS |
50 mM |
NaCl |
1.0 M |
NP-40 |
1% |
SDSb |
1% with caution |
Trise |
50 mM |
Triton-X 100 |
<1% |
Urea |
8 M |
a Beta-mercaptoethanol을 포함한 buffer를 사용하는 경우 equilibration 후 바로 resin을 사용한다. 그렇지 않은 경우 resin의 색이 노란 색으로 약하게 변색될 수 있다. 이러한 buffer로는 resin의 보관이 불가능하다.
b CHAPS (3-[(3-Cholamidopropyl)-dimethylammonio]-1-propane-sulfonate), SDS (sodium dodecyl sulfate), sarkosyl같은 ionic detergent는 최대 1% 까지만 적용 가능하다. 그러나 전하를 띄는 특성으로 인해 낮은 농도에서도 단백질 결합에 방해가 될 수 있다.
c Ethanol은 단백질을 침전시켜 수율을 감소시키고 column을 막히게 할 수 있다.
d Imidazole은 his-tagged protein의 side chain과 고정되어 있는 금속이온과의 결합에 경쟁하여 저해하기 때문에 단백질을 로딩할 때 5~10 mM 이상의 농도로 사용할 수 없다.
e Tris는 금속 이온과 약하게 상호작용하여 resin의 capacity를 감소시킨다.
TALON® cobalt resin과 호환되 않는 reagent
아래의 시약은 어떤 농도로도 resin에 적용이 불가능하다 |
- DTT (dithiothreitol) and DTE (dithioerythritol)
- 주의: 강한 환원제를 사용하는 경우 cobalt 금속 이온과 resin의 결합을 방해한다.
- EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid), EGTA (ethylene glycol tetraacetic acid), PEI
- 주의:
EDTA를 사용할 수는 있으나 TALON® Resin에 적용하기 전에 gel filtration을 통해 샘플에서 제거해야 한다.
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