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Home > 전제품보기 > NGS 관련 > Library preparation (for Illumina) > SMARTer® PicoPLEX® DNA-Seq Kit
Single Cell Library Preparation for Illumina® NGS Platforms

SMARTer® PicoPLEX® DNA-Seq Kit

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Clontech
R300381
SMARTer® PicoPLEX® DNA-Seq Kit
관련학술 관심상품등록 구매하기
48 회
가격문의   RB3381 제조사 페이지로 바로가기 PicoPLEX DNA-seq Kit Protocol-At-A-Glance_070717.pdf, PicoPLEX DNA-seq Kit User Manual_070617.pdf

  • Reduce ambiguity: 높은 재현성과 정확성으로 CNV, aneuploidy 검출
  • Reduce workflow: Single cell부터 Illumina® NGS library 제작까지 단 세 번의 실험 단계
  • Reduce cost: 제품 내 Illumina® NGS library 제작에 필요한 모든 구성품 포함 (Illumina index primer 포함)
  • Reduce contamination and error: 단 하나의 튜브(single tube)에서 진행하여 오염과 실험오류 감소?
  • Reduce time to results: Illumina® NGS library 제작까지 단 3시간
제품설명
SMARTer® PicoPLEX® 기술은 single cell을 이용하여 array 분석 시 copy number variation(CNV)을 검출하기 위하여 적용되어 왔으며 (SMARTer® PicoPLEX® WGA Kit, Code R30050), 현재 SMARTer® PicoPLEX® DNA-Seq Kit을 이용하면 single tube reaction으로 Illumina NGS platform에 적용할 수 있는 library를 만들 수 있다. SMARTer® PicoPLEX® 기술을 바탕으로 하는 SMARTer® PicoPLEX® WGA Kit(Code R30050)은 전 세계적으로 in vitro fertilization (IVF, 체외수정)시 pre-implantation genetic screening과 diagnosis를 위하여 사용되고 있다.
SMARTer® PicoPLEX® WGA Kit과 동일한 기술을 사용하는 SMARTer® PicoPLEX® DNA-Seq Kit은 single tube reaction(에러 및 오염 최소화, 반응시간 감소, 비용 감소)을 통해 NGS library preparation 과정을 최대한 간소화시켰다.
SMARTer® PicoPLEX® DNA-Seq Kit은 48회분의 Illumina® NGS Library를 제작할 수 있는 모든 구성품이 포함 (dual barcode포함) 되어있으며, NGS Barcoding oligonucleotide는 microwell plate에 분주된 형태로 제공된다.
본 제품으로 제작한 SMARTer® PicoPLEX® library는 Illumina MiSeq® System and HiSeq® 2000/2500 분석에 적용할 수 있다*.
* Illumina NextSeq® sequencer 적용하고자 할 경우, 고객지원센터로 연락바랍니다 (02-2081-2510)


[그림 1] SMARTer® PicoPLEX® DNA-Seq Kit 기술의 원리
SMARTer® PicoPLEX DNA-seq Kit uses the same technology as the WGA kit: cells are lysed, quasi-random primers pre-amplify the DNA selectively, and a final PCR amplification adds the Illumina barcodes. (SMARTer® PicoPLEX® 기술 개요 보기)


[그림 2] SMARTer® PicoPLEX® DNA-seq Kit Single-Tube Workflow


[그림 3] SMARTer® PicoPLEX® DNA-seq Kit Library Preparation Workflow for Illumina NGS Platforms
PicoPLEX® DNA-seq Kit Dual index plate map 보기


[그림 4] Individual Library Quantification Eliminated
Flow-sorted unsynchronized H929 cells were amplified, pooled with constant volume, and loaded onto a MiSeq v3 flow cell. Quantification of the libraries was unnecessary before pooling due to the highly reproducible amount of product produced by SMARTer® PicoPLEX® DNA-Seq reactions. The columns which provided no reads were wells in which the cell was absent.


[그림 5] Highly Reproducible CNV Detection Over the Entire Genome
Amplified libraries from 11 individual flow-sorted H929 cells were sequenced on an Illumina MiSeq® and downsampled to 250,000 total reads. Thirty-five base single-end reads were mapped to human over the entire genome.
Applications
Library preparation for the following cell types:
  • Reproductive health: embryonic cells to be used for subsequent preimplantation genetic screening, and circulating fetal cells for cell-based, noninvasive prenatal screening
  • Developmental biology: embryonic cells, stem cells, and rare cells
  • Cancer research: circulating tumor cells, cells or DNA from laser capture microdissection (LCM), and cells from fine needle aspirate (FNA)
  • Developmental biology: embryo cells, stem cells, and rare cells
  • Cancer research: circulating tumor cells; cells or DNA from laser capture microdissection (LCM) and fine needle aspirate (FNA)
  • Metagenomics and microbiology: microbial cells
보관
Store at -20 °C.
Guarantee for 12 months at -20°C in a constant temperature freezer.
내용 : 48 회분

Component Name

Tube Cap Color

Cell Extraction Buffer

Green

Extraction Enzyme Dilution Buffer

Violet

Cell Extraction Enzyme

Yellow

Pre-Amp Buffer

Red

Pre-Amp Enzyme

White

Amplification Buffer

Orange

Amplification Enzyme

Blue

Nuclease-Free Water

Clear

Dual Index Plate

 


Keyword : RB3381,rubicon,NGS,WGA,whole genome amplification,single cell,dna-seq,pgs,pgd
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