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Genome상의 Nucleosome 위치 분석

EpiScope® Nucleosome Preparation Kit

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Takara
5333
EpiScope® Nucleosome Preparation Kit
관련학술 관심상품등록 구매하기
50 회
468,000원  53532

  • Nucleosome에 감겨 있는 DNA 회수
  • 게놈 DNA에서 Nucleosome 위치 분석에 가능
  • 0.5~2×106개 세포에서 약 90분만에 조제 가능
제품설명
본 제품은 동물 배양세포로부터 nucleosome을 만들기 위한 Kit이다. 만들어진 nucleosome에서 추출한 DNA를 이용하여 Real Time PCR, 고속 시퀀스 분석을 통하여 게놈상에서의 nucleosome 위치를 분석할 수 있다.

실험개요
1. 세포의 용해와 핵의 원심 침강
2. 히스톤에 감겨있지 않은 DNA를 Micrococcal Nuclease를 이용하여 절단, 제거
3. Nucleosome에 Proteinase K를 처리하여 히스톤을 제거
4. DNA회수
(별도의 NucleoSpin Extract II를 이용하여 DNA정제)

회수된 DNA는 nucleosome을 형성하고 있던 게놈 DNA 영역에 해당된다. 히스톤에 감겨 있지 않은 게놈 DNA는 Micrococcal Nuclease에 의해 절단되어 제거된다.


[실험개요]
내용
(50회분)
1. Cytoplasmic Lysis Buffer 25 ml × 2개
2. Protease Inhibitor Cocktail (100 ×) 550 μl
3. Micrococcal Nuclease (20 units/μl) 50 μl
4. Micrococcal Nuclease Buffer (10× ) 1 ml
5. RNase A (20 mg/ml) 100 μl
6. 0.5 M EDTA 100 μl
7. Proteinase K (20 mg/ml) 200 μl
8. LINE-1 qPCR Primer (10 μM each)* 50 μl

* Real Time PCR으로 상대정량 분석할 때 게놈 DNA양을 보정하기 위한 reference로서 사용한다.
인간 게놈 DNA검출용 primer이므로 다른 생물 종에서는 사용할 수 없다.
보존
Component 1, 2 : 4℃
그외 구성품 : -20℃
관련제품
Thermal Cycler
  TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Gradient/Standard(Code TP600/TP650)
전기영동 장치
  Mupid-One (Code AD160)
DNA 정제 관련제품
  NucleoSpin Extract II(Code 740609.10/.50/.250, Macherey-Nagel 제품)

Keyword :
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