• 샘플을 농축할 필요 없이 single-tube workflow로 Illumina^® NGS library 제작
• Enzymatic fragmentation module 포함 (300 bp, 450 bp 선택 가능)
• FFPE, cfDNA 5 ~200 ng 로부터 고품질의 데이터 획득
• High-throughput sequencer (e.g. NovaSeq™)을 포함한 모든 기기에서 분석 가능한 높은 수율의 library 획득
• 높은 GC 부위에서도 bias 없이 향상된 성능
• Low-frequency 변이를 재현성과 민감도 높게 NGS로 분석
• Amplification과 sequencing 오류 최소화

제품 설명

ThruPLEX^® DNA-Seq HV는 96 indexed library를 이용해 Illumina^® NGS library를 이용한 multiplex 분석을 위해 제작되었다. ThruPLEX^® DNA-Seq HV는 최대 30 ㎕의 샘플을 이용해 높은 다양성과 GC representation을 보유한 DNA library를 제작할 수 있도록 최적화 되었다. Library 제작을 위해, 5 - 200 ng의 fragmentated double-stranded DNA 가 적용될 수 있다. 실험 전 과정은 single tube 혹은 single well 내에서 3-step으로 진행되며, 2시간 내 완료된다. 실험 중간에 정제 과정이 진행되거나, 샘플을 옮기는 과정이 불필요하기에, 그로 인한 샘플 손실이나 handling error를 방지할 수 있다
ThruPLEX^® DNA-Seq HV는 ThruPLEX^® HV unique dual indexes (UDIs)를 함께 사용함으로써 96-NGS-ready libraries에 대해 multiplex 분석에 적용할 수 있다. 정제, 정량이 완료된 library는 기본적으로 사용되는 Illumina sequencing 시약과 프로토콜을 이용해 Illumina NGS 기기에서 바로 분석 가능하다. 이 제품은 de novo sequencing, whole genome resequencing, whole exome sequencing 혹은 이외의 enrichment 기법의 deep sequencing을 위한 높은 coverage와 함께 최고의 결과를 얻을 수 있다. Cell-free plasma DNA 혹은 FFPE 유래의 손상된 DNA와 같은 작은 크기의 DNA에 가장 이상적으로 적용할 수 있다.
ThruPLEX^® DNA-Seq HV PLUS Kit 내 포함되어 있는 ThruPLEX^® HV PLUS Enzymatic Fragmentation Module은 enzyme을 이용한 DNA fragmentation과 repair 과정을 함께 수행할 수 있도록 고안되었다. 따라서, ThruPLEX^® HV를 이용한 sequencing library 제작 샘플 준비과정에서 별도의 기기나 추가적인 효소 처리과정 없이도 원하는 길이의 DNA (300 bp, 450 bp)를 얻을 수 있다.


그림 1. Single tube에서 ThruPLEX^® DNA-Seq HV를 이용한 library 제작 과정.
The ThruPLEX^® HV workflow consists of three simple steps that take place in the same well or PCR tube, eliminating the need to purify or transfer the sample material. In this latest version of the ThruPLEX technology, a higher input volume (30 μl) and range of input amounts (up to 200 ng) at the start of the protocol enables the generation of higher-complexity libraries and eliminates the need for sample concentration.


그림 2. Input 양과 관계없이 높은 재현성과 동일한 양상의 coverage 확인
Correlation plots are shown for replicate library preparations generated by ThruPLEX^® DNA-Seq HV with 5, 50, and 200 ng of EMD Millipore gDNA and downsampled to 20 million total reads. Coverage of each 10-kb region of hg19 was compared across inputs. Comparison of two independent 5-ng library preps (left), and two different starting inputs of 5 and 200 ng (right), demonstrate the high reproducibility of the system.

• ThruPLEX^® HV outperforms NEBNext Ultra II for DNA-seq of cell-free and FFPE DNA
  (비교 데이터를 확인하려면, 클릭하세요)
• All indexes have been functionally validated to work with Illumina sequencing systems (e.g., MiSeq^®, NovaSeq™, MiniSeq™, NextSeq^®, and HiSeq^® platforms) using two- or four-channel chemistry for base calling. They have not been validated with systems using one-channel chemistry.

자세한 구성은 CoA를 참고하세요.