각종 게놈 DNA를 절단하여 해석할 때 적합한 제한효소는 게놈 DNA의 종류에 따라 다양하다. TaKaRa는 각종 게놈 DNA 해석에 적합한 제한효소를 선정하여, 효소의 제조 lot별로 적당한 박테리아 게놈 DNA(agarose embedded, 0.5 ㎍ DNA/ 50 ㎕ 겔)에 20~150 U의 제한효소를 첨가하여 24시간 반응한 뒤 pulsed field 전기영동으로 패턴을 확인하였다. 또 QC용 게놈 DNA의 완전분해에 필요한 효소량을 산출하였다. 각 효소에 대해 5, 10, 20, 50 U의 효소를 5시간과 20시간 반응하여 효소의 필요 최소량을 측정하였다.

^*1 W : A or T, N : A or C or G or
^*2 0.5 ㎍ DNA/ 50 ㎕ 겔 +100 ㎕ 반응액
^*3 Dra I은 아가로스 겔 속에서는 극히 반응이 진행되지 않는다. 따라서 우선 적당량을 첨가하여 4℃에서 16시간 방치한 다음, 37℃로 옮겨 5시간 또는 20시간 반응시킨다.