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Home > 전제품보기 > NGS 관련 > SMARTer RNA-Seq 개요 > [기술개요] SMARTer Technology

[기술개요] SMARTer Technology

-

RNA-Seq 기술개요

Single cell, 극소량 RNA 샘플 분석의 교과서

SMART® technology


SMART® 기술

SMART® (Switching Mechanism at the 5’ end of RNA Template) 기술
역전사효소 (RTase)의 1st strand cDNA 합성이 RNA의 5' 말단에 이르렀
을 때, Non-templated nucleotides (그림 1의 XXXXX)를 부가하는 활성
(Terminal transferase activity)을 이용한다. 부가된 Non-templated
nucleotides에 독자기술로 개발한 SMARTer® switching oligo가 특이적으
로 결합하며, 이를 주형으로 cDNA 합성을 지속하여 양 말단에 SMARTer®
Adapter가 부가된 1st strand cDNA 합성을 완료한다 (Template
switching activity).

SMART® 기술은 별도의 ligation 과정 없이 1st strand cDNA 합성 과정 중
adapter를 부가할 수 있으며, 이 adapter를 이용하여 1st strand cDNA에
서만 유래된 full-length double strand cDNA를 얻을 수 있다.



SMART® 기술의 장점

  • 매우 높은 감도와 재현성: 극소량, 소량 샘플 대응
  • Full-length double strand cDNA 합성
  • 고품질의 sequencing library 제작 가능
  • 간단한 프로토콜: ligation, enzyme cocktail 처리 불필요



SMART® 기술의 적용

SMART® 법을 이용하면 1st strand cDNA 합성 과정 중에 adapter와 같은
특정 서열을 간편하게 부가할 수 있어, 다양한 실험에 적용 가능하다.


1
Next Generation Sequencing (NGS)
- 효율이 낮은 ligation 방식 대신 SMART® 기술을 적용하면,
  고효율로 NGS adapter, index를 부가할 수 있다.
- 적용: RNA-seq, DNA-seq
2
PCR, qPCR amplification
3
RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)
4
cDNA library construction