SMART® 기술
SMART® (Switching Mechanism at the 5’ end of RNA Template) 기술은
역전사효소 (RTase)의 1st strand cDNA 합성이 RNA의 5' 말단에 이르렀
을 때, Non-templated nucleotides (그림 1의 XXXXX)를 부가하는 활성
(Terminal transferase activity)을 이용한다. 부가된 Non-templated
nucleotides에 독자기술로 개발한 SMARTer
® switching oligo가 특이적으
로 결합하며, 이를 주형으로 cDNA 합성을 지속하여 양 말단에 SMARTer
®
Adapter가 부가된 1st strand cDNA 합성을 완료한다 (Template
switching activity).
SMART® 기술은 별도의 ligation 과정 없이 1st strand cDNA 합성 과정 중
adapter를 부가할 수 있으며, 이 adapter를 이용하여 1st strand cDNA에
서만 유래된 full-length double strand cDNA를 얻을 수 있다.
SMART® 기술의 장점
- 매우 높은 감도와 재현성: 극소량, 소량 샘플 대응
- Full-length double strand cDNA 합성
- 고품질의 sequencing library 제작 가능
- 간단한 프로토콜: ligation, enzyme cocktail 처리 불필요
SMART® 기술의 적용
SMART
® 법을 이용하면 1st strand cDNA 합성 과정 중에 adapter와 같은
특정 서열을 간편하게 부가할 수 있어, 다양한 실험에 적용 가능하다.
