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Home > 전제품보기 > NGS 관련 > Index Kit > [FAQ] Library index

[FAQ] Library index

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◆ General questions about indexing

(1) Takara bio.에서 판매하는 Illumina 분석용 NGS library kit는 어떻게 구성되나요?

(2) Dual index는 어떻게 사용하나요?
     How does dual indexing work?


(3) Dual index를 사용한 library가 single index를 이용한 library에 비해 좋은 점은 무엇인가요?
     What are the advantages of using dual- versus single-indexed libraries?


(4) Index hopping은 무엇인가요?
     What is index hopping?


(5) Index crosstalk 혹은 “sample bleeding” 문제를 어떻게 해결할 수 있나요?
     How can I mitigate index crosstalk or "sample bleeding" issues?


(6) Single-end reads와 paired-end reads의 차이는 무엇인가요?
     What is the difference between single and paired-end reads?


(7) Single-indexed library로 paired-end sequencing을 진행할 수 있나요?
     Can I do paired-end sequencing with single-indexed libraries?


(8) 양 말단에 index를 포함하고 있는 경우에도 single-read로 분석이 가능한가요?
     Can I perform single-read runs and still obtain both index sequences?


(9) Multiplexing 샘플을 분석할 때 무엇을 고려해야하나요?
     What should I consider when multiplexing samples?


(10) Index를 pooling할 때 지켜야하는 사항은 무엇인가요?
       What guidelines should I follow when pooling indexes?




◆ Questions about specific indexing applications <DNA-seq indexing kits>

(1) Takara Bio의 indexing kits는 다른 회사의 library prep kit와 호환이 되나요?
       Are Takara Bio indexing kits compatible with library prep kits from other companies?


(2) ThruPLEX와 PicoPLEX library prep. Kits는 다른 회사의 indexing kit와 호환이 되나요?
       Are indexing kits from other companies compatible with ThruPLEX and PicoPLEX library prep kits?


(3) Unique dual index kits로 제작된 library는 TruSeq CD index를 이용해 제작된 library와 함께 pooling될 수 있나요?
       Can libraries made with your DNA unique dual index kits be pooled with libraries made using TruSeq CD indexes?


(4) Takara Bio DNA unique dual index는 Illumina TruSeq UD 혹은 IDT for Illumina UD 서열과 동일한가요?
       Are the Takara Bio DNA unique dual indexes the same as the Illumina TruSeq UD or IDT for Illumina UD sequences?


(5) 96 well-plate로 제공되는 index의 경우, 한 번 사용 시 몇 개씩 사용하면 되나요?
       For indexes in 96-well-plate format: can I generate just a few samples at a time?


(6) ThruPLEX DNA library 제작에 사용된 index adapter 서열은 어떻게 되나요?
       What are the index adapter sequences after preparation using ThruPLEX DNA libraries?