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Home > 전제품보기 > NGS 관련 > High input DNA-seq > ThruPLEX® DNA-Seq HV
FFPE, cell-free DNA-seq 분석 제품

ThruPLEX® DNA-Seq HV

-

제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Clontech
R400782
ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit
관련학술 구매하기 라이선스 
24 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기 ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS User Manual-020821.pdf
Clontech
R400783
ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit
관련학술 구매하기 라이선스 
96 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기
Clontech
R400741
ThruPLEX® DNA-Seq HV
관련학술 구매하기 라이선스 
24 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기 ThruPLEX DNA-Seq HV User Manual_031320.pdf
Clontech
R400740
ThruPLEX® DNA-Seq HV
관련학술 구매하기 라이선스 
96 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기
Clontech
R400739
ThruPLEX® HV UDI 1-24
관련학술 구매하기
24 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기 ThruPLEX HV UDI Protocol-at-a-Glance_022720.pdf
Clontech
R400738
ThruPLEX® HV UDI Set A
관련학술 구매하기
96 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기 ThruPLEX HV UDI Protocol-at-a-Glance_022720.pdf

* ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit 내에는 enzymatic fragmentation module을 포함하고 있습니다.
* 제품 내에는 HV 전용 UDI가 포함되어 있으며, 추가로 필요시에만 구매 바랍니다. HV 전용이 아닌 index는 호환되지 않으니, 참고 바랍니다.


* 위 제품은 high volume을 위한 제품입니다. Low volume DNA를 사용하고자 할 때에는 아래의 제품으로 사용 바랍니다.

- Low volume DNA-seq library preparation) ThruPLEX® DNA-Seq Kit (Code R400674)
분류

Low volume input

High volume input

input DNA

1 ~ 50 ng of DNA

5 ~ 200 ng of DNA

sample

10 ㎕

30 ㎕


  • 샘플을 농축할 필요 없이 single-tube workflow로 Illumina® NGS library 제작
  • Enzymatic fragmentation module 포함 (300 bp, 450 bp 선택 가능)
  • FFPE, cfDNA 5 ~200 ng 로부터 고품질의 데이터 획득
  • High-throughput sequencer (e.g. NovaSeq™)을 포함한 모든 기기에서 분석 가능한 높은 수율의 library 획득
  • 높은 GC 부위에서도 bias 없이 향상된 성능
  • Low-frequency 변이를 재현성과 민감도 높게 NGS로 분석
  • Amplification과 sequencing 오류 최소화

제품 설명
ThruPLEX® DNA-Seq HV는 96 indexed library를 이용해 Illumina® NGS library를 이용한 multiplex 분석을 위해 제작되었다. ThruPLEX® DNA-Seq HV는 최대 30 ㎕의 샘플을 이용해 높은 다양성과 GC representation을 보유한 DNA library를 제작할 수 있도록 최적화 되었다. Library 제작을 위해, 5 - 200 ng의 fragmentated double-stranded DNA 가 적용될 수 있다. 실험 전 과정은 single tube 혹은 single well 내에서 3-step으로 진행되며, 2시간 내 완료된다. 실험 중간에 정제 과정이 진행되거나, 샘플을 옮기는 과정이 불필요하기에, 그로 인한 샘플 손실이나 handling error를 방지할 수 있다
ThruPLEX® DNA-Seq HV는 ThruPLEX® HV unique dual indexes (UDIs)를 함께 사용함으로써 96-NGS-ready libraries에 대해 multiplex 분석에 적용할 수 있다. 정제, 정량이 완료된 library는 기본적으로 사용되는 Illumina sequencing 시약과 프로토콜을 이용해 Illumina NGS 기기에서 바로 분석 가능하다. 이 제품은 de novo sequencing, whole genome resequencing, whole exome sequencing 혹은 이외의 enrichment 기법의 deep sequencing을 위한 높은 coverage와 함께 최고의 결과를 얻을 수 있다. Cell-free plasma DNA 혹은 FFPE 유래의 손상된 DNA와 같은 작은 크기의 DNA에 가장 이상적으로 적용할 수 있다.
ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit 내 포함되어 있는 ThruPLEX® HV PLUS Enzymatic Fragmentation Module은 enzyme을 이용한 DNA fragmentation과 repair 과정을 함께 수행할 수 있도록 고안되었다. 따라서, ThruPLEX® HV를 이용한 sequencing library 제작 샘플 준비과정에서 별도의 기기나 추가적인 효소 처리과정 없이도 원하는 길이의 DNA (300 bp, 450 bp)를 얻을 수 있다.


그림 1. Single tube에서 ThruPLEX® DNA-Seq HV를 이용한 library 제작 과정.
The ThruPLEX® HV workflow consists of three simple steps that take place in the same well or PCR tube, eliminating the need to purify or transfer the sample material. In this latest version of the ThruPLEX technology, a higher input volume (30 μl) and range of input amounts (up to 200 ng) at the start of the protocol enables the generation of higher-complexity libraries and eliminates the need for sample concentration.


그림 2. Input 양과 관계없이 높은 재현성과 동일한 양상의 coverage 확인
Correlation plots are shown for replicate library preparations generated by ThruPLEX® DNA-Seq HV with 5, 50, and 200 ng of EMD Millipore gDNA and downsampled to 20 million total reads. Coverage of each 10-kb region of hg19 was compared across inputs. Comparison of two independent 5-ng library preps (left), and two different starting inputs of 5 and 200 ng (right), demonstrate the high reproducibility of the system.

자세한 구성은 CoA를 참고하세요.

[ThruPLEX® DNA-Seq HV]
- ThruPLEX DNA-Seq HV Core Components
- ThruPLEX HV UDI 1-24 or Set A
- Control Fragmented Human gDNA (5 ng / μl)

[ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit]
- ThruPLEX HV PLUS Enzymatic Fragmentation Module Set A
- ThruPLEX DNA-Seq HV Core Components
- ThruPLEX HV UDI 1-24 or Set A
- Control Fragmented Human gDNA (5 ng / μl)

Keyword : High volume,DNA-seq,FFPE,cfDNA,cell-free DNA,DNA fragment,Enzymatic fragmentation,NGS,Next generation sequencing,NovaSeq,UDI,Unique dual index,Rubicon,루비콘,Cancer research,암연구,Cancer

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