TaKaRa
로그인  |   회원가입  |   ID/PW 찾기   |  제품상담문의  
제품명/제품코드
키워드검색
검색
닫기
  • 고객지원센터 
  • 업무안내│학술지원
  • 전화번호│02-2081-2510
  • Email     │support@takara.co.kr
  • 대전지사 
  • 업무안내│대전/충청지역 주문, 학술지원
  • 전화번호│042-828-6525
  • Email     │tkbd@takara.co.kr
  • 업무시간안내
  • [ 평  일 ] 09 : 00 ~ 18 : 00 │ [ 점심시간 ] 12 : 00 ~ 13 : 00
  • 토·일요일, 공휴일은 휴무입니다.
Home > 전제품보기 > NGS 관련 > High input DNA-seq > ThruPLEX® Tag-Seq HV
UMI가 도입된 FFPE, cell-free DNA-seq 분석 제품

ThruPLEX® Tag-Seq HV

-

제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Clontech
R400784
ThruPLEX® Tag-Seq HV PLUS Kit
관련학술 구매하기 라이선스 
24 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기 ThruPLEX Tag-Seq HV PLUS User Manual-020821.pdf
Clontech
R400785
ThruPLEX® Tag-Seq HV PLUS Kit
관련학술 구매하기 라이선스 
96 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기
Clontech
R400742
ThruPLEX® Tag-Seq HV
관련학술 구매하기 라이선스 
24 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기 ThruPLEX%20Tag-Seq%20HV%20User%20Manual_022720.pdf
Clontech
R400743
ThruPLEX® Tag-Seq HV
관련학술 구매하기 라이선스 
96 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기
Clontech
R400739
ThruPLEX® HV UDI 1-24
관련학술 구매하기
24 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기 ThruPLEX HV UDI Protocol-at-a-Glance_022720.pdf
Clontech
R400738
ThruPLEX® HV UDI Set A
관련학술 구매하기
96 회
가격문의   제조사 페이지로 바로가기 ThruPLEX HV UDI Protocol-at-a-Glance_022720.pdf

* ThruPLEX® Tag-Seq HV PLUS Kit 내에는 enzymatic fragmentation module을 포함하고 있습니다.
* 제품 내에는 HV 전용 UDI가 포함되어 있으며, 추가로 필요시에만 구매 바랍니다. HV 전용이 아닌 index는 호환되지 않으니, 참고 바랍니다.


  • 샘플을 농축할 필요 없이 single-tube workflow로 Illumina® NGS library 제작
  • Enzymatic fragmentation module 포함 (300 bp, 450 bp 선택 가능)
  • FFPE, cfDNA 5 ~200 ng 로부터 고품질의 데이터 획득
  • High-throughput sequencer (e.g. NovaSeq™)을 포함한 모든 기기에서 분석 가능한 높은 수율의 library 획득
  • 높은 GC 부위에서도 bias 없이 향상된 성능
  • Incorporation of discrete, balanced molecular tags (UMIs) in ThruPLEX Tag-Seq HV
  • Low-frequency 변이를 재현성과 민감도 높게 NGS로 분석
  • Amplification과 sequencing 오류 최소화

제품 설명
ThruPLEX® Tag-Seq HV는 96 indexed library를 이용해 Illumina® NGS library를 이용한 multiplex 분석을 위해 제작되었다. ThruPLEX® Tag-Seq HV는 최대 30 ㎕의 샘플을 이용해 높은 다양성과 GC representation을 보유한 DNA library를 제작할 수 있도록 최적화 되었다. Library 제작을 위해, 5 - 200 ng의 fragmentated double-stranded DNA가 적용될 수 있다. 실험 전 과정은 single tube 혹은 single well 내에서 3-step으로 진행되며, 2시간 내 완료된다. 실험 중간에 정제 과정이 진행되거나, 샘플을 옮기는 과정이 불필요하기에, 그로 인한 샘플 손실이나 handling error를 방지할 수 있다
ThruPLEX® Tag-Seq HV는 ThruPLEX® HV unique dual indexes (UDIs)를 함께 사용함으로써 96-NGS-ready libraries에 대해 multiplex 분석에 적용할 수 있다. 정제, 정량이 완료된 library는 기본적으로 사용되는 Illumina sequencing 시약과 프로토콜을 이용해 Illumina NGS 기기에서 바로 분석 가능하다. 이 제품은 de novo sequencing, whole genome resequencing, whole exome sequencing 혹은 이외의 enrichment 기법의 deep sequencing을 위한 높은 coverage와 함께 최고의 결과를 얻을 수 있다. Cell-free plasma DNA 혹은 FFPE 유래의 손상된 DNA와 같은 작은 크기의 DNA에 가장 이상적으로 적용할 수 있다.

ThruPLEX® Tag-Seq HV PLUS Kit 내 포함되어 있는 ThruPLEX® HV PLUS Enzymatic Fragmentation Module은 enzyme을 이용한 DNA fragmentation과 repair 과정을 함께 수행할 수 있도록 고안되었다. 따라서, ThruPLEX® HV를 이용한 sequencing library 제작 샘플 준비과정에서 별도의 기기나 추가적인 효소 처리과정 없이도 원하는 길이의 DNA (300 bp, 450 bp)를 얻을 수 있다.


그림 1. Single tube에서 ThruPLEX® Tag-Seq HV를 이용한 library 제작 과정.
The ThruPLEX® Tag-Seq HV workflow consists of three simple steps that take place in the same PCR tube or well and eliminates the need to purify or transfer the sample material.


그림 2. ThruPLEX® Tag-Seq HV 내 포함되어 있는 144개 조합이 가능한 unique molecular identifiers (UMIs)
The ThruPLEX® Tag-Seq HV is designed to remove the ambiguity in variant calling by reducing the false positive calls coming from DNA polymerase and sequencing errors. The seven base UMIs are located at the beginning of the reads ensuring an easy demultiplexing of the samples to simplify the analysis


그림 3. Human gDNA로부터 제작된 library에서 낮은 GC 확인
Libraries were prepared from 5 ng and 50 ng of sheared human genomic DNA (Horizon Discovery Quantitative Multiplex Reference Standard, Cat. # HD701) using ThruPLEX® Tag-Seq HV. Libraries were sequenced on an Illumina MiSeq® instrument, and reads were aligned to the human genome (HG19) using bowtie2. The alignment metrics and GC bias were calculated using Picard tools.

  • All indexes have been functionally validated to work with Illumina sequencing systems (e.g., MiSeq®, NovaSeq™, MiniSeq™, NextSeq®, and HiSeq® platforms) using two- or four-channel chemistry for base calling. They have not been validated with systems using one-channel chemistry.
자세한 구성은 CoA를 참고하세요.

[ThruPLEX® Tag-Seq HV]
- ThruPLEX Tag-Seq HV Core Components
- ThruPLEX HV UDI 1-24 or Set A
- Control Fragmented Human gDNA (5 ng / μl)

[ThruPLEX® Tag-Seq HV PLUS Kit]
- ThruPLEX HV PLUS Enzymatic Fragmentation Module Set A
- ThruPLEX Tag-Seq HV Core Components
- ThruPLEX HV UDI 1-24 or Set A
- Control Fragmented Human gDNA (5 ng / μl)

Keyword : High volume,DNA-seq,FFPE,cfDNA,cell-free DNA,Tag-seq,UMI,Unique Molecular Index,DNA fragment,Enzymatic fragmentation,NGS,Next generation sequencing,NovaSeq,UDI, Unique dual index,Rubicon,루비콘,Cancer research,암연구,Cancer

High input DNA-seq
>
FFPE, cell-free DNA-seq 분석 제품
ThruPLEX® DNA-Seq HV
>
UMI가 도입된 FFPE, cell-free DNA-seq 분석 제..
ThruPLEX® Tag-Seq HV