
반응 시간 |
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효율 |
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활용성 |
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특징 |
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형태 |
액상 |
동결 건조 |
Control vector, insert 포함 |
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원하는 reaction volume 혹은 plate/tube 등에서 사용 |
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HTP 적용을 위한 편리한 scale up |
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1회분으로 분주 및 동결 건조되어, handling error 최소화 |
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실온에서 보관 가능 |
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In-Fusion® Snap Assembly |
Gibson assembly-based cloning |
Colony 수 |
다소 복잡한 실험 (예 - multiple cloning, large insert/vector 등)에서도 타 방식에 비해 colony가 많이 형성됨 |
복잡한 실험의 경우 colony가 적게 형성되거나, 형성되지 않음 |
Nick 수복 과정 |
Polymerase를 이용하지 않고, competent cell에서 nick을 수복하여, 이로 인한 불필요한 염기 추가 등의 에러 최소화 |
DNA polymerase가 enzyme mix 내 포함되어 있어, error가 수복 부위에서 발생할 수 있음. |
Ligase를 사용하지 않아, self ligation 등의 백그라운드가 나타날 확률이 적음 |
in vitro ligation을 이용하므로, empty vector 등 백그라운드가 나타날 확률이 높음. |
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반응 시간 |
15 분 |
~ 60 분 |
A-overhang insert 교정 |
3’ → 5’ exonuclease 활성을 이용해, PCR 과정에서 임의로 부가된 A 1염기의 교정이 가능함 |
5’ → 3’ exonuclease 활성을 이용하기에, PCR 과정에서 임의로 부가된 A 1염기에 대한 교정이 불가능해, 정확도가 떨어짐 |
PCR primer 디자인 |
15 bp overlap으로, PCR 조건 설정 시 유리 |
일반적으로 20 ~ 30 bp overlap |