Q1. Á¦Ç°Àº µ¿°áº¸Á¸ÀÌÁö¸¸, µ¿°áÀ¶Çظ¦ ¹Ýº¹Çصµ ±¦ÂúÀº°¡¿ä?
10ȸÀÇ µ¿°áÀ¶ÇØ¿¡¼´Â ¼º´É¿¡ ¿µÇâÀÌ ¾ø´Ù°í È®ÀεǾú½À´Ï´Ù. ±× ÀÌ»óÀÇ µ¿°áÀ¶Çظ¦ ÇÒ °æ¿ì¿¡´Â ÃÖÃÊ À¶ÇØ ½Ã¿¡ ºÐÁÖÇÏ¿© º¸°üÇØÁÖ¼¼¿ä.
Q2. Hot start PCR¿ë È¿¼Ò¿¡ ´ëÇØ ÃÖÃÊÀÇ È°¼ºÈ ´Ü°è´Â ÇÊ¿äÇÏÁö ¾ÊÀº°¡¿ä?
Á¦Ç°¿¡ »ç¿ëµÇ´Â
TaKaRa Ex Taq¢ç HS´Â
polymerase È°¼ºÀ» ¾ïÁ¦ÇÏ´Â anti-Taq Ç×ü¸¦ ÀÌ¿ëÇÏ´Â Hot start PCR¿ë È¿¼ÒÀÔ´Ï´Ù.
Ÿ»çÀÇ ÈÇÐ½Ä Å¸ÀÔÀÇ Hot start PCR È¿¼Ò¿¡¼ ¿ä±¸µÇ´Â PCR ¹ÝÀÀ ÀüÀÇ 95¡É, 5~15ºÐÀÇ È°¼ºÈ ´Ü°è(denaturation)´Â ÇÊ¿äÇÏÁö ¾Ê½À´Ï´Ù. ¿ÀÈ÷·Á ±ÇÀå ½Ã°£ ÀÌ»ó
(ÀϹÝÀûÀ¸·Î 30ÃÊ, gDNA ¶Ç´Â circular DNAÀÇ ÁõÆø½Ã ÃÖ´ë 2ºÐ)ÀÇ ¿Ã³¸®¸¦ °¡Çϸé È¿¼ÒÈ°¼ºÀÌ ÀúÇϵǾî ÁõÆøÈ¿À² ¹× Á¤·® Á¤¹Ðµµ°¡ °¨¼ÒÇÏ°Ô µË´Ï´Ù.
Q3. RT-PCR¿¡¼ cDNA(RT ¹ÝÀÀ¾×)À» ÁÖÇüÀ¸·Î ÷°¡ÇÒ °æ¿ì, ¾ó¸¶±îÁö ÷°¡ °¡´ÉÇÑ°¡¿ä?
PCR ¹ÝÀÀ ¿ë·®ÀÇ 10% ÀÌÇÏ (25 §¡ ¹ÝÀÀÀÇ °æ¿ì´Â 2.5 §¡±îÁö)·Î »ç¿ëÇϼ¼¿ä.
Real time RT-PCRÀ» ½Ç½ÃÇÒ °æ¿ì´Â
TB Green¢â Premix Ex Taq¢â II (Tli RNaseH Plus) (Code RR820A)
°ú ¿ªÀü»ç ¹ÝÀÀ ½Ã¾àÀÌ ¼¼Æ®·Î µÇ¾î ÀÖ´Â
One Step TB Green¢â PrimeScript¢â PLUS RT-PCR Kit (Perfect Real Time) (Code RR096A)¸¦ »ç¿ëÀ» ±ÇÀåÇÕ´Ï´Ù.
Q4. Á¦Ç°À» ¿ëÇØÇߴµ¥ ħÀü¹°ÀÌ ÀÖ½À´Ï´Ù. »ç¿ëÇصµ ±¦ÂúÀº°¡¿ä?
¼ÕÀ¸·Î µû¶æÇÏ°Ô ÇØÁְųª Â÷±¤ÇÏ¿© ½Ç¿Â¿¡ Àá½Ã µÐ ÈÄ ºÎµå·´°Ô ¼¯À¸¸é, ħÀü¹°Àº Á¦°Å µË´Ï´Ù. ħÀü¹°ÀÌ ¿ëÇØµÇ¸é ¼º´É»ó¿¡ ÀüÇô ¹®Á¦°¡ ¾ø½À´Ï´Ù.
½ÉÇÑ vortexÀÇ »ç¿ëÀº ÇÇÇϽñ⠹ٶø´Ï´Ù.
Q5. Áö±Ý±îÁö 3-step PCRÀ» ÇؿԴµ¥, ÀÌ ½Ã¾àÀ» »ç¿ëÇÒ °æ¿ì´Â 2-step PCR·Î ¹Ù²Ù´Â °ÍÀÌ ÁÁÀº°¡¿ä?
´ç»ç ½Ã¾àÀÇ °æ¿ì, Ç¥ÁØ ÇÁ·ÎÅäÄÝ·Î Shuttle PCR (2-step PCR)À» ±ÇÇÏ°í ÀÖÀ¸¹Ç·Î, ¸ÕÀú 2-step PCRÀ» ÀÌ¿ëÇϽñ⠹ٶø´Ï´Ù. Annealing/Extension ¿Âµµ´Â
ÀϹÝÀûÀ¸·Î 60¡É¸¦ ±ÇÀåÇÏ°í ÀÖÁö¸¸, ÃÖÀûȸ¦ À§ÇØ 60~66¡ÉÀÇ ¹üÀ§¿¡¼ °ËÅ並 ±ÇÀåÇÕ´Ï´Ù. Annealing/Extension ¿Âµµ¸¦ 68¡É·Î ¼³Á¤Çϸé primer bindingÀÌ
ºÒ¿ÏÀüÇÏ¿© ÁõÆø È¿À²ÀÌ ÀúÇ쵃 °æ¿ì°¡ ÀÖÀ¸¹Ç·Î ÁÖÀÇÇϼ¼¿ä. Shuttle PCR¿¡¼ ¹ÝÀÀ¼ºÀÌ ³ª»Ü °æ¿ì, 3-step PCR·Î º¯°æÇØ º¸½Ã±â ¹Ù¶ø´Ï´Ù. Real time PCRÀ»
È¿À²ÀûÀ¸·Î ½Ç½ÃÇϱâ À§Çؼ´Â ¹ÝÀÀ¼ºÀÌ ÁÁÀº primer¸¦ ¼³°èÇÏ´Â °ÍÀÌ Áß¿äÇÕ´Ï´Ù. Cycling Á¶°ÇÀ» º¯°æÇصµ ÁÁÀº °á°ú¸¦ ¾òÁö ¸øÇÑ °æ¿ì´Â primer¸¦
»õ·Ó°Ô design ÇÒ °ÍÀ» ±ÇÀåÇÕ´Ï´Ù.
Q6. Á¦Ç°¿¡ ÷°¡µÇ¾î ÀÖ´Â ROX Reference Dye³ª ROX Reference Dye ¥±´Â ¾îµð¿¡ »ç¿ëÇϴ°¡¿ä?
Applied Biosystems»çÀÇ Real time PCR ÀåÄ¡(ABI PRISM 7000/7700/7900HT, Applied Biosystems 7300/7500 Real-Time PCR System)À» »ç¿ëÇÒ °æ¿ì¿¡ well °£
º¸Á¤¿ë dye·Î »ç¿ëÇÕ´Ï´Ù. ¹ÝÀÀ¾×¿¡ 1/50 ¾çÀ» ÷°¡ÇÏ¿© »ç¿ëÇϼ¼¿ä. 7500 Real-Time PCR System¿¡´Â ROX Reference Dye ¥±¸¦, ABI PRISM 7000 µî¿¡´Â ROX Reference Dye¸¦
»ç¿ëÇϼ¼¿ä. Smart Cycler SystemÀ̳ª LightCycler¸¦ »ç¿ëÇÒ °æ¿ì´Â ÇÊ¿äÇÏÁö ¾Ê½À´Ï´Ù.