Post-transcriptional capping tech note
Post-transcriptional capping은 IVT (
in vitro transcription)으로 mRNA를 합성한 이후 5’-말단을 enzyme으로 modification하는 방법이다. Enzymatic capping라고도 부르며, 특허가 없기 때문에 상대적으로 비용이 저렴하고 매우 높은 capping efficiency를 가지고 있다(80~100%) (Grudzien et al., 2004).
■ Reagents
Vaccinia Capping Enzyme (Code 2460A) (VCE)은 7-methylguanylate cap 구조 (m
7G 혹은 Cap-0)를 uncapped mRNA의 5’ 말단에 부가한다. 이 제품에는 capping 반응을 위해 필요한 모든 시약들 (10x Capping Buffer, GTP, S-adenosylmethionine (SAM))이 포함되어 있고 모든 실험을 한시간 내에 완료할 수 있다.
Component |
Concentration |
Size* |
Vaccinia Capping Enzyme |
10 U/㎕ |
500 U |
10x Capping Buffer |
10x |
100 ㎕ |
S-adenosylmethionine (SAM) |
32 mM |
100 ㎕ |
GTP |
10 mM |
50 ㎕ |
*500 U의
Vaccinia Capping Enzyme (Code 2460A)는 50 x 20 ㎕ 만큼의 반응액에 사용할 수 있다.
mRNA Cap 2’-O-Methyltransferase (Code 2470A) (2’-O-MTase)는 SAM을 methyl donor로 사용하여 mRNA의 5’ 말단의 첫 nucleotide (+1)의 2’-O 위치에 메틸기를 추가해 cap-1 구조를 형성한다.
Component |
Concentration |
Size* |
mRNA Cap 2'-O-Methyltransferase |
50 U/㎕ |
2500 U |
10X Capping Buffer |
10X |
100 ㎕ |
S-adenosylmethionine (SAM) |
32 mM |
100 ㎕ |
*2500 U의
mRNA Cap 2’-O-Methyltransferase (Code 2470A)는 50 x 20 ㎕ 만큼의 반응액에 사용할 수 있다.
■ Procedure: VCE and 2'-O-MTase, one-step vs. two-step protocol
Post transcriptional capping은 mRNA에 cap-0 구조를 추가한 뒤 cap-1 구조로 변경하기 때문에, VCE (uncapped RNA -> cap0 RNA)와 2'-O-MTase (cap0 RNA -> cap1 RNA)을 순차적으로 사용한다 (2-step reaction; 그림 1). 그러나 아래와 같이VCE의 capping과 2'-O-MTase의 methylation을 동시에 진행하기도 한다 (1-step reaction; 그림1). 이에 대한 자세한 내용은 각 제품페이지와 사용자 매뉴얼을 참고할 수 있다.
그림 1. Post-transcriptional capping 방법. Vaccinia Capping Enzyme (Code 2460A) (VCE)와
mRNA Cap 2’-O-Methyltransferase (Code 2470A) (2’-O-MTase)를 사용하는 capping법은 1-step과 2-step 두 가지 방법으로 진행될 수 있다. 자세한 내용은 사용자 매뉴얼을 참고할 수 있다.
■ 관련제품
- Template 준비부터 IVT까지 고품질 고수율 시스템
Takara IVTpro™ mRNA Synthesis System (Code 6141)
-
[Upgrade] Template 준비부터 고품질 IVT까지
Takara IVTpro™ mRNA Synthesis System (low dsRNA) (Code 6131)
- IVT전 vector의 선형화에 사용하는 Type IIS 제한효소
BspQ I (Code 1227A)
-
BspQ I과 같이 사용할 수 있는 IVT용 Template 제작 키트
Cloning Kit for mRNA Template (BspQ I) (Code 6133)
- Cloning시 CDS서열을 정확하게 PCR:
PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase (Code R050A)
- 임상분야 연구개발에 적합한 dsRNA 혼입이 적은:
PrimeCap™ T7 RNA Polymerase (low dsRNA) (Code 2560A)