• Reduce ambiguity: 높은 재현성과 정확성으로 CNV, aneuploidy 검출
• Reduce workflow: Single cell부터 Illumina^® NGS library 제작까지 단 세 번의 실험 단계
• Reduce cost: 제품 내 Illumina^® NGS library 제작에 필요한 모든 구성품 포함 (Illumina index primer 포함)
• Reduce contamination and error: 단 하나의 튜브(single tube)에서 진행하여 오염과 실험오류 감소?
• Reduce time to results: Illumina^® NGS library 제작까지 단 3시간

제품설명

PicoPLEX^® 기술은 single cell을 이용하여 array 분석 시 copy number variation(CNV)을 검출하기 위하여 적용되어 왔으며 (PicoPLEX^® WGA Kit, Code R30050), 현재 PicoPLEX^® DNA-Seq Kit을 이용하면 single tube reaction으로 Illumina NGS platform에 적용할 수 있는 library를 만들 수 있다. PicoPLEX^® 기술을 바탕으로 하는 PicoPLEX^® WGA Kit(Code R30050)은 전 세계적으로 in vitro fertilization (IVF, 체외수정)시 pre-implantation genetic screening과 diagnosis를 위하여 사용되고 있다.
PicoPLEX^® WGA Kit과 동일한 기술을 사용하는 PicoPLEX^® DNA-Seq Kit은 single tube reaction(에러 및 오염 최소화, 반응시간 감소, 비용 감소)을 통해 NGS library preparation 과정을 최대한 간소화시켰다.
PicoPLEX^® DNA-Seq Kit은 48회분의 Illumina^® NGS Library를 제작할 수 있는 모든 구성품이 포함 (dual barcode포함) 되어있으며, NGS Barcoding oligonucleotide는 microwell plate에 분주된 형태로 제공된다.
본 제품으로 제작한 PicoPLEX^® library는 Illumina MiSeq^® System and HiSeq^® 2000/2500 분석에 적용할 수 있다*.
* Illumina NextSeq^® sequencer 적용하고자 할 경우, 고객지원센터로 연락바랍니다 (02-2081-2510)


[그림 1] PicoPLEX^® DNA-Seq Kit 기술의 원리
PicoPLEX DNA-seq Kit uses the same technology as the WGA kit: cells are lysed, quasi-random primers pre-amplify the DNA selectively, and a final PCR amplification adds the Illumina barcodes. (PicoPLEX^® 기술 개요 보기)


[그림 2] PicoPLEX^® DNA-seq Kit Single-Tube Workflow


[그림 3] PicoPLEX^® DNA-seq Kit Library Preparation Workflow for Illumina NGS Platforms
PicoPLEX^® DNA-seq Kit Dual index plate map 보기


[그림 4] Individual Library Quantification Eliminated
Flow-sorted unsynchronized H929 cells were amplified, pooled with constant volume, and loaded onto a MiSeq v3 flow cell. Quantification of the libraries was unnecessary before pooling due to the highly reproducible amount of product produced by PicoPLEX^® DNA-Seq reactions. The columns which provided no reads were wells in which the cell was absent.


[그림 5] Highly Reproducible CNV Detection Over the Entire Genome
Amplified libraries from 11 individual flow-sorted H929 cells were sequenced on an Illumina MiSeq^® and downsampled to 250,000 total reads. Thirty-five base single-end reads were mapped to human over the entire genome.

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