ChIP-seq

(Chromatin Immunoprecipitation followed by sequencing)

ChIP-seq은 ChIP 실험으로 농축한 DNA 영역을 NGS로 분석하는 방법으로, 에피제네틱스 연구를 위한 필수적인 기술이다.
ChIP-seq은 사용하는 세포의 수가 적고 ChIP으로부터 회수되는 DNA의 양이 매우 적기 때문에 미량의 ChIP DNA 분석법을 확립하는 것은 매우 중요한 과제이다.
다카라코리아는 미량의 ChIP DNA 또는 Cut&Run DNA로부터 재현성 높은 NGS 분석이 가능한 NGS Library Preparation Kit를 제공한다.

ChIP-seq Challenge with Takara

너무 적은 ChIP DNA 양 때문에 불가능했던 ChIP-seq 분석, 이제 가능합니다.

Takara ChIP-seq Library Preparation Kits (for Illumina^®)

피코그람 수준의 low input ChIP DNA
10,000개의 세포 (10⁴ cells) ChIP-seq 가능
Single stranded ChIP DNA 분석 (ssDNA)
간단한 프로토콜로 짧은 시간 내, NGS Library 제작

	Code	제품명	적용기술	Input DNA 양	Input DNA 형태
BEST	R400674	SMARTer^® ThruPLEX^® DNA-Seq Kit	ThruPLEX^®	50 pg - 50 ng	Fragmented dsDNA
	634865	DNA SMART™ ChIP-Seq Kit	SMART-Seq^®	100 pg - 10 ng	Fragmented dsDNA, ssDNA

ChIP-seq, Cut&Run-seq Library Preparation

SMARTer^® ThruPLEX^® DNA-Seq Kit (Code R400674)

Fast	2시간이면 NGS Library 제작 완료 (Hands-on time 15분)
Simple	3-Step protocol in single tube (No transfer, No purification)
High performance	50 pg - 50 ng ChIP DNA, gDNA, cfDNA

양이 너무 적어서 어려웠던 ChIP-seq, 가능합니다!

50 pg ChIP DNA뿐만 아니라 10,000개 세포로도 ChIP-seq 가능

피코그람 수준의 ChIP DNA (50 pg - 50 ng)로도 NGS Library 제작 및 분석
10,000 cells (10⁴ cells)에서 유의미한 ChIP-seq 데이터 분석 가능

Low cell number ChIP-seq using SMARTer^® ThruPLEX^® DNA-Seq Kit

Cells : Bovine fibroblast, blastomere cells
Low cell number (10⁴ cells) : SMARTer^® ThruPLEX^® DNA-Seq Kit으로 제작 후, Illumina NextSeq^® 500으로 서열 분석
High cell number (10⁷ cells) : Illumina^® TruSeq^® Kit으로 제작 후, Illumina NextSeq^® 500으로 서열 분석