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High-throughput single-cell mRNA-Seq (Single cell or Ultra low input)

SMART-Seq® HT Kit

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Clontech
634437
SMART-Seq® HT Kit
관련학술 관심상품등록 구매하기 라이선스 
96회
7,644,000원  제조사 페이지로 바로가기 137366
Clontech
634438
SMART-Seq® HT Kit
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192회
10,546,000원  제조사 페이지로 바로가기
Clontech
634436
SMART-Seq® HT Kit
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480회
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Clontech
634439
SMART-Seq® HT Lysis Components
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96회
174,000원  제조사 페이지로 바로가기 137366

  • Unparalleled sensitivity - Single cell 또는 10pg total RNA에서 분석 가능 (Input range: 1 - 100 cells or 10 pg - 1 ng of total RNA)
  • High-quality RNA-seq data - SMARTer® Ultra Low Kit 시리즈 중, 유전자 검출 수가 가장 많고 rRNA read 비중이 낮으며 GC-rich transcript도 효율적
  • Simplified workflow - One-Step RT-PCR 반응으로 NGS 분석용 cDNA를 한번에 제작
  • Sample prep made easy - Single-tube protocol로 단일세포 샘플의 손실을 최소화
제품설명
SMART-Seq® HT Kit은 10 pg - 1ng total RNA 또는 1 - 100개의 세포에서 RNA 추출 과정 없이 고품질의 Full-length cDNA를 빠르고 대량(High-throughput)으로 제작할 수 있는
제품이다. 본 제품은 SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencing (Code 634888)의 기술을 기반으로 하고 있어 동일한 성능의 민감도 (sensitivity)와 재현성 (reproducibility)를 보이며, 역전사반응 (Reverse Transcription)과 PCR 증폭을 합친 Single Step RT-PCR 반응으로 간편하고 빠르게 NGS Library를 제작할 수 있다. cDNA 합성 과정은
단 4시간에 완료할 수 있으며, 전체적인 NGS Library 제작은 이틀 내에 완료할 수 있다.
본 키트에 적용된 SMART 기술은 splice junction, alternative splicing 등을 포함한 full transcriptome 분석을 위하여 개발된 강력한 기술이며, 이는 full-length gene coverage에 대한
분석을 가능하게 한다. Oligo(dT) priming을 이용하여 high-quality RNA (RIN > 8) 또는 intake cell로부터 mRNA를 증폭한다. LNA (Locked Nucleic Acid) 기술의 사용으로 주형전환활성 (template switching) 활성을 한층 높였으며, 이는 검출되는 유전자의 수를 증가시켰다.


그림 1. Schematic of technology in the SMART-Seq HT Kit.


그림 2. Comparison of the SMART-Seq v4 and SMART-Seq HT kit workflows
(왼쪽) SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencing (Code 634888)
(오른쪽) SMART-Seq® HT Kit (Code 634437)
SMART-Seq® HT Kit (오른쪽)은 기존의 SMART-Seq v4 (왼쪽)의 프로토콜을 변형함으로써, 보다 간편하고 빠르게 High-throughput으로 NGS Library를 제작할 수 있다.
FACS sorting으로 Single cell 분리 후, SMART-Seq v4 의 경우는 총 6번의 Hands-on step이 필요한 데 반하여, SMART-Seq HT Kit의 경우는 단 3번의 Hands-on step으로
완료할 수 있다.


그림 3. High reproducibility of gene expression data obtained from FACS-sorted 293T cells using the SMART-seq v4 and SMART-Seq HT kits. (데이터 자세히보기)


그림 4. Comparison of expression level by gene GC content between the SMART-Seq v4 and SMART-Seq HT kits (데이터 자세히보기)


그림 5. High overlap of transcripts identified with the SMART-Seq v4 and SMART-Seq HT kits (데이터 자세히 보기)
Applications
  • cDNA synthesis from single cells or total RNA for transcriptome sequencing
  • cDNA outputs from this kit can be used with Nextera® XT library preparation kits for Illumina sequencing
구성품 (자세한 내용은 COA를 참조하세요)
SMART-Seq® HT Kit (Code 634437, 634438, 634436)
  • Box 1: Control Total RNA (1㎍/㎕)
  • Box 2: SMART-Seq HT Oligonucleotide
    - 3' SMART-Seq CDS Primer II A
    - RNase Inhibitor(40 U/㎕)
    - One-Step Buffer
    - SMARTScribe Reverse Transcriptase(100 U/㎕)
    - SeqAmp DNA Polymerase
    - 10X Lysis Buffer
    - Elution Buffer(10 mM Tris-Cl, pH 8.5)
    - Nuclease-Free Water

SMART-Seq® HT Lysis Components (Code 634439)
  • 3' SMART-Seq CDS Primer II A
  • 10X Lysis Buffer
보존
  • Box 1: - 70℃
  • Box 2: - 20℃

Keyword : Single cell,NGS,SMART,SMARTer,RNA-Seq,Single cell seq,단일세포,시퀀싱,Sequencing
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