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DNA SMART ChIP-Seq Kit

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Clontech
634865
DNA SMART ChIP-Seq Kit - 12
관련학술 관심상품등록 구매하기 라이선스 
12회
1,077,000원  제조사 페이지로 바로가기 99449
Clontech
634866
DNA SMART ChIP-Seq Kit - 48 A
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48회
3,516,000원  제조사 페이지로 바로가기 99449
Clontech
634867
DNA SMART ChIP-Seq Kit - 48 B
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48회
3,516,000원  제조사 페이지로 바로가기 99449
Clontech
634887
ChIP Elute Kit
관련학술 관심상품등록 구매하기
50 Rxns
731,000원  제조사 페이지로 바로가기 103472

ChIP Elute Kit은 chromatin immunoprecipitation (ChIP) 방법으로 얻어진 DNA를 회수, 정제할 수 있는 제품이다. 본 제품을 사용하면 Single-stranded DNA (ssDNA)를 약 1시간만에 회수할 수 있으며, 회수된 DNA는 DNA SMART ChIP-Seq Kit (code 634865)에 바로 적용할 수 있다.

DNA SMART ChIP-Seq Kit은 별도의 ligation 과정 없이(Ligation-independent manner), 목적 DNA 양 말단에 Illumina-specific sequencing adaptor를 부가하여 Illumina platform에 적합한 DNA Library를 제작하는 제품이다. Chromatin Immunoprecipitation(ChIP)으로부터 회수한 DNA는 양이 매우 적기 때문에 Chromatin Immunoprecipitation-sequencing(ChIP-Seq)에 적용하기가 매우 어렵다. DNA SMART ChIP-Seq Kit은 ligation 과정 없이, 100 pg - 10 ng의 소량의 DNA 샘플로부터 Illumina platform용 sequencing library를 제작할 수 있다. 또한 절단 또는 분해된 double strand DNA(dsDNA) 뿐만 아니라 single-strand DNA(ssDNA)도 이용할 수 있기 때문에 ssDNA로부터 dsDNA로 만들기 위한 별도의 과정이 필요 없다. 본 제품을 이용하면 약 4시간만에 효율적으로 library 제작이 가능하다.

본 제품은 Clontech 특허의 SMART 기술을 적용한 새로운 제품으로 DNA 주형으로부터 DNA를 합성할 수 있다 (DNA dependent DNA polymerase). DNA SMART ChIP-Seq Kit의 핵심은 극소량의 샘플 (low-input sample)로부터 ligation 과정 없이 Illumina용 sequencing adaptor를 부가할 수 있다는 점이다.
특징
  • Ligation-independent adaptor addition for ChIP-seq library preparation
  • Flexible DNA inputs: 100 pg-10 ng of either ssDNA or dsDNA, or total DNA from 10,000-1,000,000 cell ChIP experiments
  • Simple Protocol: Generate Illumina-ready sequencing libraries in around 4 hours

그림 1. This single-tube workflow. allows users to generate Illumina-compatible libraries for ChIP-seq experiments. After library size selection and purification, the total time from input DNA to ChIP-seq library is approximately four hours.


표 1. The DNA SMART ChIP-Seq Kit uses a combined size selection and clean-up step after library amplification by PCR. Compared to other protocols that perform size selection before PCR amplification, post-PCR size selection results in a higher yield while maintaining the quality of the libraries.


표 2. The DNA SMART ChIP-Seq Kit has the sensitivity to generate sequencing libraries from very small amounts of fragmented DNA. The number of unique, non-duplicate reads is high across all input levels, and the number of peaks identified is similar across input amounts.
적용
  • Sequencing library preparation for ChIP-seq from low-input, fragmented DNA
  • Illumina-specific NGS sequencing library production
구성품 (자세한 구성품은 CoA 또는 매뉴얼 참조)
- DNA SMART ChIP-Seq Components
- Indexing Primer Set HT for Illumina
- SeqAmp DNA Polymerase

제품코드

제품명

Note

634865

DNA SMART ChIP-Seq Kit - 12

the reagents to generate up to 12 indexed libraries using a single forward primer and the 12 reverse indexing primers

634866

DNA SMART ChIP-Seq Kit - 48 A

generate up to 48 indexed libraries using the first 4 forward primers and the 12 reverse indexing primers

634867

DNA SMART ChIP-Seq Kit - 48 B

generate up to 48 indexed libraries using the second 4 forward primers and the 12 reverse indexing primers


Keyword : NGS,DNA-Seq,SMART,ChIP,Illumina
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Low Input DNA-Seq Kit (ChIP)
> DNA SMART ChIP-Seq Kit
> Micrococcal Nuclease
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