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50pg ChIP DNA-seq 분석을 위한 NGS Library Kit

SMARTer® ThruPLEX® DNA-seq Kit

제조사	제품코드	제품명	용량	가격 (부가세별도)
Clontech	R400674	ThruPLEX® DNA-Seq Kit	24회	가격문의
Clontech	R400675	ThruPLEX® DNA-Seq Kit	48회	가격문의
Clontech	R400676	ThruPLEX® DNA-Seq Kit	96회	가격문의
Clontech	R400677	ThruPLEX® DNA-Seq Kit	480회 (R400676 x 5)	가격문의

Product index

Overview
DNA Methlyation 연구
Methylated DNA 분리와 분석
- EpiXplore Methylated D..
- Meth-Seq DNA Enrichmen..
Chromatin 면역 침감 (ChIP)
ChIP-seq, Cut&Run-seq (NGS..
miRNA 발현 · 정량
Epigenetics를 위한 Cloning..
- Online In-Fusion Tools
- Mighty TA-cloning Kit

* 잠깐, 첫 구매인가요? 다카라코리아 고객지원센터 (Tel. 02-2081-2510)로 연락주세요!

* 본 제품은 기존 ThruPLEX® DNA-seq Kit (Code R400523)의 업그레이드 버전 제품이며, indexing primer kit가 포함되어있지 않습니다.

High performance from low inputs - 미량의 DNA 샘플 (50 pg ~ 50 ng)로부터 Illumina^® NGS library 제작
Fast and simple workflow - 튜브 이동 없이 단일튜브 (single-tube or single-well)에서 세 번의 실험 과정 (3 step)으로 제작 완료 (library 제작 시간 : 약 2시간)
Compatible with major target enrichment platforms - 주요 Target Enrichment 플랫폼에 적용 가능 - Agilent SureSelect^®, Roche Nimblegen^® SeqCap^® EZ, and IDT xGen^® Lockdown^® probes 외
※ DNA Target Enrichment Protocol 자세히 보기

제품설명

ThruPLEX^® DNA-seq Kit은 ThruPLEX^® 기술을 이용하여 극소량의 DNA로부터 Illumina^® NGS Library를 제작할 수 있는 제품이다. 본 제품을 이용하면 불과 50 pg 수준의 극소량 DNA로 최대 384 multiplexing에 대응 가능한 Illumina^® NGS Library를 제작 가능하다. 본 제품은 샘플 종류에 상관없이 fragmentation된 DNA라면 모두 적용이 가능하다 (Genomic, biofluids such as cell-free DNA, DNA from FFPE materials, cDNA).
ThruPLEX^® DNA-seq Kit을 이용하면 단일튜브에서 튜브 이동 없이 2시간 만에 NGS Library를 제작 가능하다. ThruPLEX^® DNA-seq Kit은 다양한 DNA-seq application과 RNA-seq을 위한 cDNA 그리고 ChIP-seq 등에 사용될 수 있으며, 주요 target enrichment platform protocol도 함께 제공되고 있다 (※ DNA Target Enrichment Protocol 자세히 보기).

본 제품은 기존 ThruPLEX^® DNA-Seq Kit의 업그레이드 제품이며, Illumina index는 포함하고 있지 않다. 다카라바이오에서 제공하는 모든 DNA Index Kits를 적용 가능하다 ( DNA Index Kit 바로가기)

그림 1. ThruPLEX DNA-Seq single-tube library preparation workflow. The ThruPLEX DNA-Seq workflow consists of three simple steps that take place in the same PCR tube or well, eliminating the need to purify and transfer the sample material.)

그림 2. ThruPLEX^® 기술 (자세히 보기)
Step 1. 단편화된 double stranded DNA 말단을 고효율로 Repair한다
Step 2. DNA 절편의 5’ 말단에 Stem-Loop adapter가 ligation되며, 3’ 말단에는 nick을 남긴다. 이후 extension 과정을 통해 Stem-Loop adapter의 일부가 제거된다.
Stem-Loop adapter는 노출된 단일가닥이 없고, 5’ 말단이 block되어 있어 adapter간의 dimer 형성이 억제될 뿐만 아니라 서열 분석에서의 background를 감소시킬 수 있다.
Step 3. Illumina^® index가 포함된 primer로 증폭하여 Illumina^® NGS 분석용 Llibrary 제작을 완료한다.

표 1. DNA Sample Requirements for ThruPLEX^® DNA-seq Kit

DNA Sample Requirements
Nucleic Acid	Fragmented double-stranded DNA or cDNA
Source	Cells, plasma, urine, other biofluids, FFPE, tissues, fresh tissues, frozen tissues
Type	Mechanically sheared; enzymatically fragmented; ChIP-DNA; low-molecular weight cell-free DNA
Molecular Weight	< 1,000 bp
Input Amount	50 pg - 50 ng
Input Volume	10 ㎕

* 자세한 내용은 사용자 매뉴얼을 참고하세요.

Application

* 링크를 클릭하시면 ThruPLEX^® DNA-seq Kit의 다양한 실험 데이터를 확인하실 수 있습니다.

Application	Technical Note
ChIP-Seq	Low cell number ChIP-seq using the ThruPLEX DNA-seq kit as a tool for epigenetic profiling
FFPE DNA	A streamlined solution for generating high-quality NGS libraries from FFPE DNA samples
Low input exome-seq	Low-input whole-exome sequencing using ThruPLEX technology and Agilent SureSelect Target Enrichment Systems
Low volume DNA shearing	Using Covaris microTUBE-15 to shear samples for ThruPLEX library preparation

구성품 (자세한 내용은 CoA를 참조하세요)

ThruPLEX^® DNA-seq Kit

Template Preparation D Buffer
Template Preparation D Enzyme
Library Synthesis D Buffer
Library Synthesis D Enzyme
Library Amplification D Buffer
Library Amplification Enzyme
Nuclease-Free Water

Keyword :

ChIP-seq, Cut&Run-seq (NGS)

[적용] 소량세포로부터 ChIP-seq 분석법

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