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Bacterial 16S rDNA PCR Kit Fast

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Takara
RR182A
Bacterial 16S rDNA PCR Kit Fast (800)
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50 tests
517,000원  87424

제품설명
본 제품은 세균류의 16S ribosomal DNA(rDNA)영역 내의 특정 영역(약 0.8 kb)을 증폭할 수 있는 시약과 PCR증폭 산물의 sequencing용 primer로 구성되어 있다. 본 제품으로 증폭된 PCR 산물은 sequencing으로 분석된 염기서열과 데이터베이스내 서열과 상동성을 검색하여 세균을 분류 할 수 있다. 개량형 Taq DNA polymerase를 사용해서 고속 PCR조건에서 신속하게 PCR증폭을 실시할 수 있다. 또한 항체를 이용한 hot-start PCR 효소로 cycle 전 mis-priming이나 primer-dimer 유래의 비특이적 증폭을 막을 수 있다.

※본 제품에 제공되는 primer를 이용한 분석과정은 16차 개정된 Japanese Pharmacopoeia의 “Rapid Identification of Microorganisms Using Genetic Analysis” 부분에 수록되어 있다.

[주의] 세균 종류에 따라 본 키트로 PCR증폭할 수 없는 경우가 있다.
진균의 경우는 Fungal rDNA(ITS1)PCR Kit Fast(Code RR183A)또는 Fungal rDNA(D1/D2)PCR Kit Fast(Code RR184A)을 이용하십시오.
내용
(25 μl PCR반응, 50회)

1.

TaKaRa Taq HS Fast Detect Premix(2×)

625 μl

2.

16S rDNA Primer Mix (800)*1 (10x)

125 μl

3.

dH2O

650 μl

4.

Positive Control (E. coli DNA) (1 ng/μl)

25 μl

5.

Sequencing Primer 10F (7.5 pmol/μl)

50 μl

6.

Sequencing Primer 800R (7.5 pmol/μl)

50 μl


*1 16S rDNA Primer Mix(800)에 포함되는 primer는 Sequencing Primer 10F와 Sequencing Primer 800R과 같은 서열이다.
보존
- 20℃
TaKaRa Taq HS Fast Detect Premix에는 PCR효소가 포함되어 있기 때문에 동결 융해를 자주 반복하면 활성이 낮아지는 경우가 있다.
녹일 때 격렬한 vortex를 피하고 융해 후에는 부드럽게 잘 섞어준다.
DNA증폭 산물의 서열 분석
제품에 포함된 Sequencing Primer 10F로 증폭 산물의 서열을 분석한다.
필요에 따라 Sequencing Primer 800R을 사용해 양방향 분석을 실시한다. 양방향으로 분석하면 정밀도 높은 데이터를 얻을 수 있다.
염기 서열 정보의 해석
염기서열 정보를 데이터베이스 상의 상동서열 검색을 통해 세균의 종류를 유추한다.

<참고 정보>
BLAST검색은 BLAST알고리즘을 구현된 프로그램을 다운로드하고 이용할 수 있다.
NCBI BLAST:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
NCBI와 DDBJ의 web 에서도 사용할 수 있다.
NCBI : http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
DDBJ : http://blast.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html
별도로 필요한 주요 시약과 기기
유전자 증폭 시스템(authorized instruments)
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch (Code TP350)
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Gradient/Standard (Code TP600)

PCR tube*
0.2 ml Hi-Tube Dome Cap (Code NJ200)
0.2 ml Hi-Tube Flat Cap Recovery (Code NJ203)
0.2 ml Hi-8-Tube (Code NJ300)
0.2 ml Hi-8-Dome Cap (Code NJ301)
0.2 ml Hi-8-Flat Cap (Code NJ302)

Agarose 전기 영동 장치
Mupid-2plus (Code AD110)
Mupid-exU (Code AD140)
Mupid-One (Code AD160)

Agarose Gel
SeaKem LE Agarose, Lonza (Code 50004)
NuSieve 3:1 Agarose, Lonza (Code 50091)

DNA Staining
GelStar Nucleic Acid Stain(Code 50535),
TB Green™(Code 50512/50513),
EtBr
주)GelStar, TB Green™를 사용하는 경우는 전용 필터가 필요합니다.

PCR산물 정제 시약
TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit (Code 9762A)
TaKaRa MiniBEST DNA Fragment Purification Kit (Code 9761A)

Keyword :
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미생물 추정 및 해석용 (PCR)
PCR 산물 Sequence 해석으로 세균을 추정
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> Fungal rDNA (ITS1) PCR Kit Fast
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