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Bacterial 16S rDNA PCR Kit Fast

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Takara
RR182A
Bacterial 16S rDNA PCR Kit Fast (800)
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50 tests
517,000원  87424

제품설명
본 제품은 세균류의 16S ribosomal DNA(rDNA)영역 내의 특정 영역(약 0.8 kb)을 증폭할 수 있는 시약과 PCR증폭 산물의 sequencing용 primer로 구성되어 있다. 본 제품으로 증폭된 PCR 산물은 sequencing으로 분석된 염기서열과 데이터베이스내 서열과 상동성을 검색하여 세균을 분류 할 수 있다. 개량형 Taq DNA polymerase를 사용해서 고속 PCR조건에서 신속하게 PCR증폭을 실시할 수 있다. 또한 항체를 이용한 hot-start PCR 효소로 cycle 전 mis-priming이나 primer-dimer 유래의 비특이적 증폭을 막을 수 있다.

※본 제품에 제공되는 primer를 이용한 분석과정은 16차 개정된 Japanese Pharmacopoeia의 “Rapid Identification of Microorganisms Using Genetic Analysis” 부분에 수록되어 있다.

[주의] 세균 종류에 따라 본 키트로 PCR증폭할 수 없는 경우가 있다.
진균의 경우는 Fungal rDNA(ITS1)PCR Kit Fast(Code RR183A)또는 Fungal rDNA(D1/D2)PCR Kit Fast(Code RR184A)을 이용하십시오.
내용
(25 μl PCR반응, 50회)

1.

TaKaRa Taq HS Fast Detect Premix(2×)

625 μl

2.

16S rDNA Primer Mix (800)*1 (10x)

125 μl

3.

dH2O

650 μl

4.

Positive Control (E. coli DNA) (1 ng/μl)

25 μl

5.

Sequencing Primer 10F (7.5 pmol/μl)

50 μl

6.

Sequencing Primer 800R (7.5 pmol/μl)

50 μl


*1 16S rDNA Primer Mix(800)에 포함되는 primer는 Sequencing Primer 10F와 Sequencing Primer 800R과 같은 서열이다.
보존
- 20℃
TaKaRa Taq HS Fast Detect Premix에는 PCR효소가 포함되어 있기 때문에 동결 융해를 자주 반복하면 활성이 낮아지는 경우가 있다.
녹일 때 격렬한 vortex를 피하고 융해 후에는 부드럽게 잘 섞어준다.
DNA증폭 산물의 서열 분석
제품에 포함된 Sequencing Primer 10F로 증폭 산물의 서열을 분석한다.
필요에 따라 Sequencing Primer 800R을 사용해 양방향 분석을 실시한다. 양방향으로 분석하면 정밀도 높은 데이터를 얻을 수 있다.
염기 서열 정보의 해석
염기서열 정보를 데이터베이스 상의 상동서열 검색을 통해 세균의 종류를 유추한다.

<참고 정보>
BLAST검색은 BLAST알고리즘을 구현된 프로그램을 다운로드하고 이용할 수 있다.
NCBI BLAST:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
NCBI와 DDBJ의 web 에서도 사용할 수 있다.
NCBI : http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
DDBJ : http://blast.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html
별도로 필요한 주요 시약과 기기
유전자 증폭 시스템(authorized instruments)
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch (Code TP350)
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Gradient/Standard (Code TP600)

PCR tube*
0.2 ml Hi-Tube Dome Cap (Code NJ200)
0.2 ml Hi-Tube Flat Cap Recovery (Code NJ203)
0.2 ml Hi-8-Tube (Code NJ300)
0.2 ml Hi-8-Dome Cap (Code NJ301)
0.2 ml Hi-8-Flat Cap (Code NJ302)

Agarose 전기 영동 장치
Mupid-2plus (Code AD110)
Mupid-exU (Code AD140)
Mupid-One (Code AD160)

Agarose Gel
SeaKem LE Agarose, Lonza (Code 50004)
NuSieve 3:1 Agarose, Lonza (Code 50091)

DNA Staining
GelStar Nucleic Acid Stain(Code 50535),
SYBR Green I(Code 50512/50513),
EtBr
주)GelStar, SYBR Green I를 사용하는 경우는 전용 필터가 필요합니다.

PCR산물 정제 시약
TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit (Code 9762A)
TaKaRa MiniBEST DNA Fragment Purification Kit (Code 9761A)

Keyword :
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미생물 추정 및 해석용 (PCR)
PCR 산물 Sequence 해석으로 세균을 추정
> Bacterial 16S rDNA PCR Kit
> Bacterial 16S rDNA PCR Kit Fast
> Fungal rDNA (ITS1) PCR Kit Fast
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