- 높은 정확도: 99% 이상의 정확도로 각 전사체의 origin 가닥 식별 가능
- 빠르고 간소화된 프로토콜: 단 5시간 만에 library 제작
- 넓은 input 범위: human, rat, mouse의 total RNA 100 ng-1 μg
- 다양한 샘플 적용성: RIN (RNA Integrity Number) 값이 1-3 정도의 total RNA에서도 높은 재현성의 고품질 데이터를 생산
- High throughput Illumina sequencing: 384개의 unique index를 사용하여 최대 384개의 샘플로 Illumina-ready library 제작 가능
제품 설명
본 제품은 100 ng-1 ㎍의 mammalian total RNA로부터 Illumina sequencing library를 준비하기 위한 효율적인 솔루션을 제공한다. 또한 RiboGone™과 SMART® 기술을 결합하여 효율적으로 rRNA를 제거하고 strand 방향성 정보가 유지되는 library의 원활한 생산이 가능하다.
rRNA는 total RNA의 ~90% 이상을 차지하기 때문에 library 생성 전에 rRNA가 효과적으로 제거가 되어야 sequencing 비용을 낮추고 mapping statistics를 향상시킬 수 있다.
SMART® 기술을 이용한 cDNA 합성 과정과 PCR을 통해 Unique Dual Index Kits (Code 634752-634756, 별도구매)에 있는 index 및 adaptor를 추가하고, strand 방향성을 부여하여 간단하게 library prep 프로세스를 완료할 수 있다. 또한 rRNA 제거부터 Illumina용 index가 추가된 RNA-Seq library 준비까지 약 5시간 내 완성된다.
*기타 input amount에 따른 추천 제품 :
- Total RNA 250 pg-10 ng : SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian (Code 634485 외)
- Total RNA 10-100 ng : SMART-Seq® Total RNA Mid Input (Code 635049 외)
적용
- Illumina 플랫폼을 이용한 mammalian sample의 RNA-Seq
- Strand 방향성 정보를 유지하는 NGS library 준비
- coding 및 noncoding 서열 정보 분석
자세한 구성은 CoA를 참고하세요.
RNA-Seq 러닝센터를 통해 본 제품에 대한 더 많은 데이터와 FAQ를 참고하세요.
